More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4061 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  100 
 
 		 579 aa  1148    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  58.79 
 
 		 581 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  50.52 
 
 		 581 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  48.53 
 
 		 611 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  53.11 
 
 		 581 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 579 aa  486  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  45.04 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 579 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  43.06 
 
 		 595 aa  455  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  46.31 
 
 		 590 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.31 
 
 		 601 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.8 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 646 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.23 
 
 		 581 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  42.55 
 
 		 579 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  36.08 
 
 		 608 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.05 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 601 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  35.47 
 
 		 574 aa  272  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  35.38 
 
 		 668 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 578 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  35.78 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.88 
 
 		 626 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  34.78 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  36.1 
 
 		 628 aa  230  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  31.73 
 
 		 652 aa  228  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.42 
 
 		 618 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  30.4 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  27.68 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2049  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 663 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  29.92 
 
 		 666 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  29.72 
 
 		 665 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.83 
 
 		 617 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  31.85 
 
 		 672 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  30.21 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  32.57 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  30.21 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.37 
 
 		 600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  33.03 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  30.86 
 
 		 672 aa  217  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  26.49 
 
 		 631 aa  216  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.3 
 
 		 595 aa  216  8e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.05 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  30.82 
 
 		 687 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.82 
 
 		 634 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.12 
 
 		 621 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1267  ABC transporter related  27.35 
 
 		 623 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00288622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  29.19 
 
 		 639 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  30.39 
 
 		 669 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.79 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  30.8 
 
 		 640 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0386  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.62 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.15 
 
 		 640 aa  208  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.51 
 
 		 670 aa  208  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.84 
 
 		 587 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.4 
 
 		 597 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  28.93 
 
 		 613 aa  207  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.24 
 
 		 575 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  27.66 
 
 		 587 aa  207  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.34 
 
 		 627 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.4 
 
 		 597 aa  207  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  27.66 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  27.66 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.66 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.66 
 
 		 587 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 		 567 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.54 
 
 		 587 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  31.82 
 
 		 642 aa  206  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  31.75 
 
 		 606 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  29.62 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  27.54 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  30.23 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  27.58 
 
 		 614 aa  204  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  30.36 
 
 		 606 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  31.23 
 
 		 658 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0785  ABC transporter transmembrane region  31.28 
 
 		 701 aa  203  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244223  hitchhiker  0.00200741 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.98 
 
 		 567 aa  203  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  29.39 
 
 		 811 aa  203  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  30.03 
 
 		 641 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1525  multidrug ABC transporter ATPase/permease  28.88 
 
 		 607 aa  203  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 640 aa  203  9e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  28.17 
 
 		 622 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.86 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  29.89 
 
 		 627 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  26.36 
 
 		 618 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.55 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  25.09 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  29.89 
 
 		 627 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  30.98 
 
 		 567 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  26.6 
 
 		 594 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.83 
 
 		 614 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 600 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  28.15 
 
 		 587 aa  201  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.49 
 
 		 608 aa  201  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  25.51 
 
 		 592 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  30.41 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.72 
 
 		 608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>