More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3042 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  60 
 
 
595 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  64.64 
 
 
577 aa  719    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  68.63 
 
 
579 aa  773    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  100 
 
 
577 aa  1128    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  69.57 
 
 
580 aa  741    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.93 
 
 
601 aa  586  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  54.28 
 
 
611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  56.87 
 
 
581 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  56.68 
 
 
590 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
579 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
581 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
581 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  49.65 
 
 
579 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  45.65 
 
 
646 aa  443  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
579 aa  438  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.34 
 
 
668 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.14 
 
 
608 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.41 
 
 
581 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  39.89 
 
 
601 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.91 
 
 
610 aa  302  1e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  36.27 
 
 
610 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  36.82 
 
 
628 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  35.58 
 
 
574 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
578 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
609 aa  276  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.47 
 
 
626 aa  270  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.76 
 
 
598 aa  263  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  33.94 
 
 
595 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.38 
 
 
610 aa  248  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.93 
 
 
605 aa  247  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.39 
 
 
610 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.39 
 
 
610 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.78 
 
 
598 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  33.56 
 
 
634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.78 
 
 
598 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.32 
 
 
598 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  29.6 
 
 
607 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  34.35 
 
 
612 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.24 
 
 
598 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.14 
 
 
608 aa  240  5e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  30.85 
 
 
614 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  30.57 
 
 
594 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  30.85 
 
 
614 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  26.9 
 
 
588 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  27.1 
 
 
618 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  31.6 
 
 
598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.68 
 
 
597 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  27.32 
 
 
598 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  27.69 
 
 
571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.89 
 
 
614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 
571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 
571 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.69 
 
 
571 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.69 
 
 
571 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.38 
 
 
606 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.36 
 
 
631 aa  233  9e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  28.52 
 
 
575 aa  233  9e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.69 
 
 
571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.5 
 
 
571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  33.16 
 
 
633 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.69 
 
 
571 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.5 
 
 
571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.27 
 
 
622 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.61 
 
 
602 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.96 
 
 
571 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  27.4 
 
 
594 aa  231  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  31.18 
 
 
619 aa  230  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  28.75 
 
 
594 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  31.27 
 
 
615 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.13 
 
 
600 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  31.63 
 
 
601 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  28.95 
 
 
617 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  29.98 
 
 
606 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  27.14 
 
 
598 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.14 
 
 
598 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.89 
 
 
582 aa  227  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.14 
 
 
598 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.91 
 
 
595 aa  227  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  33.66 
 
 
602 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.14 
 
 
598 aa  226  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.17 
 
 
587 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  30.5 
 
 
663 aa  226  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  29.38 
 
 
597 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  31.79 
 
 
616 aa  226  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.82 
 
 
609 aa  225  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.65 
 
 
626 aa  226  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.96 
 
 
598 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  26.89 
 
 
587 aa  226  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.07 
 
 
596 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  26.87 
 
 
605 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  31.47 
 
 
636 aa  225  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.13 
 
 
590 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.22 
 
 
628 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.22 
 
 
617 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  30.26 
 
 
613 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  27.48 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  32.4 
 
 
620 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.66 
 
 
1257 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  27.46 
 
 
598 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  28.89 
 
 
640 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>