More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3826 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  100 
 
 		 628 aa  1175    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  62.31 
 
 		 610 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  43.43 
 
 		 595 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.68 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  47.19 
 
 		 601 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  41.16 
 
 		 668 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  45.09 
 
 		 608 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  40.5 
 
 		 574 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 578 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  36.82 
 
 		 577 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 579 aa  313  4.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 609 aa  313  7.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  37.48 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.69 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  37.69 
 
 		 611 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.84 
 
 		 601 aa  297  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.72 
 
 		 580 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  36.89 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 579 aa  257  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  38.72 
 
 		 590 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 632 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.1 
 
 		 610 aa  240  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  38.37 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 640 aa  234  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  34.72 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 632 aa  231  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.23 
 
 		 581 aa  230  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.27 
 
 		 606 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 622 aa  228  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.12 
 
 		 622 aa  227  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.93 
 
 		 614 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.43 
 
 		 608 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 614 aa  224  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  28.82 
 
 		 576 aa  223  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  29.55 
 
 		 611 aa  223  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  34.06 
 
 		 658 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 606 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  32.22 
 
 		 619 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 598 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  34.08 
 
 		 642 aa  220  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  33.77 
 
 		 634 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  28.24 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  28.24 
 
 		 578 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  34.24 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.83 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  33.61 
 
 		 659 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  32.55 
 
 		 636 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  31.25 
 
 		 623 aa  218  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 596 aa  217  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  31.86 
 
 		 605 aa  217  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.17 
 
 		 611 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  35.64 
 
 		 579 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  32.64 
 
 		 567 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  34.38 
 
 		 615 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  32.84 
 
 		 611 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  33.5 
 
 		 658 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  32.21 
 
 		 648 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 628 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.11 
 
 		 578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 624 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 606 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 635 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  32.97 
 
 		 1301 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.12 
 
 		 654 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  29.14 
 
 		 908 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  31.46 
 
 		 631 aa  211  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  27.96 
 
 		 906 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.29 
 
 		 631 aa  210  5e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  33.23 
 
 		 632 aa  211  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  29.77 
 
 		 601 aa  211  5e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  31.66 
 
 		 641 aa  210  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  31.93 
 
 		 626 aa  210  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  27.3 
 
 		 583 aa  210  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.19 
 
 		 611 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.55 
 
 		 671 aa  210  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 613 aa  209  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  29.68 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.05 
 
 		 640 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.2 
 
 		 1257 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  33.45 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  34.51 
 
 		 652 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  26.83 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  33.96 
 
 		 638 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  27.79 
 
 		 906 aa  209  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  28.04 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  34.74 
 
 		 635 aa  208  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  31.94 
 
 		 637 aa  208  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  34.89 
 
 		 600 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  29.08 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  29.91 
 
 		 617 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0275  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 651 aa  206  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.64 
 
 		 608 aa  206  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>