More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5181 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  65.4 
 
 		 581 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1194    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  56.72 
 
 		 579 aa  605  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  59.86 
 
 		 579 aa  599  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  54.45 
 
 		 577 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  54.28 
 
 		 577 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  52.97 
 
 		 595 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  55.12 
 
 		 590 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.01 
 
 		 580 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.35 
 
 		 601 aa  542  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  53.2 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  50.34 
 
 		 646 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 579 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  43.43 
 
 		 579 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  39.25 
 
 		 668 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.66 
 
 		 608 aa  336  7.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  40.92 
 
 		 610 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.7 
 
 		 581 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.19 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 578 aa  303  8.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  38 
 
 		 574 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.54 
 
 		 626 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  37.69 
 
 		 628 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  36.74 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.62 
 
 		 595 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 601 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.36 
 
 		 605 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.33 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.41 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.15 
 
 		 610 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.15 
 
 		 610 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  27.84 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  33.59 
 
 		 606 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.62 
 
 		 597 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.73 
 
 		 606 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  34.01 
 
 		 619 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  32.58 
 
 		 613 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.22 
 
 		 614 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.44 
 
 		 1284 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.22 
 
 		 631 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  33.87 
 
 		 652 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  30.78 
 
 		 629 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  33.2 
 
 		 615 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  33.98 
 
 		 634 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  33.27 
 
 		 672 aa  240  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  29.07 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.69 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.59 
 
 		 666 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  27.42 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 615 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  30.32 
 
 		 636 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.83 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.83 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.83 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.83 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 614 aa  237  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.26 
 
 		 589 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  25.71 
 
 		 618 aa  236  6e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  33.46 
 
 		 593 aa  237  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.83 
 
 		 587 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.53 
 
 		 575 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  32.45 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.09 
 
 		 621 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.99 
 
 		 587 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.12 
 
 		 606 aa  233  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.98 
 
 		 626 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32 
 
 		 614 aa  233  8.000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  31.44 
 
 		 639 aa  232  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 623 aa  233  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.81 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.51 
 
 		 721 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  27.56 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  33.86 
 
 		 633 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.21 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  30.78 
 
 		 638 aa  231  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.21 
 
 		 608 aa  231  4e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  29.95 
 
 		 629 aa  231  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.63 
 
 		 595 aa  230  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  32.46 
 
 		 594 aa  230  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  30.04 
 
 		 598 aa  230  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  29.92 
 
 		 614 aa  229  9e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  32 
 
 		 672 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 596 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  31.35 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.62 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.88 
 
 		 600 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.27 
 
 		 634 aa  228  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.16 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  33.2 
 
 		 1301 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  31.54 
 
 		 642 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  29.89 
 
 		 572 aa  227  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.18 
 
 		 585 aa  227  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  30.45 
 
 		 601 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.2 
 
 		 598 aa  226  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  29.82 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  26.88 
 
 		 626 aa  226  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>