More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0747 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  100 
 
 		 590 aa  1127    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  56.68 
 
 		 577 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  56.78 
 
 		 579 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  56.6 
 
 		 577 aa  589  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  55.12 
 
 		 611 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  51.8 
 
 		 595 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.43 
 
 		 601 aa  558  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.75 
 
 		 580 aa  553  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  55.61 
 
 		 581 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  50.77 
 
 		 581 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 581 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  52.77 
 
 		 579 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  46.1 
 
 		 579 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  38.94 
 
 		 668 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  38.67 
 
 		 608 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.62 
 
 		 581 aa  306  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  38.69 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 578 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  40.6 
 
 		 610 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.75 
 
 		 610 aa  277  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 601 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  38.46 
 
 		 609 aa  273  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.85 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  28.57 
 
 		 597 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.66 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.66 
 
 		 610 aa  263  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  28.57 
 
 		 597 aa  262  1e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  26.55 
 
 		 617 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  36.88 
 
 		 595 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  34.31 
 
 		 605 aa  258  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.07 
 
 		 595 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  34.36 
 
 		 619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.91 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  38 
 
 		 666 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  39.7 
 
 		 1218 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  33.28 
 
 		 596 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  27.97 
 
 		 620 aa  250  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  32.87 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.17 
 
 		 597 aa  249  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.53 
 
 		 625 aa  249  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34.11 
 
 		 606 aa  248  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  33.84 
 
 		 666 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  30.07 
 
 		 640 aa  244  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  38.48 
 
 		 628 aa  243  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  27.68 
 
 		 615 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.65 
 
 		 596 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 615 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  34.23 
 
 		 672 aa  239  6.999999999999999e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 618 aa  239  9e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.8 
 
 		 1284 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  33.21 
 
 		 631 aa  239  9e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 608 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  30.43 
 
 		 594 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  32.54 
 
 		 634 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  26.8 
 
 		 588 aa  237  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  33.02 
 
 		 631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  33.02 
 
 		 631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  26.09 
 
 		 628 aa  236  6e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  32.59 
 
 		 606 aa  236  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  34.01 
 
 		 652 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.53 
 
 		 591 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  30.88 
 
 		 629 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  34.36 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5937  ABC transporter related  32.86 
 
 		 765 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268315  normal  0.587315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.03 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.09 
 
 		 638 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.84 
 
 		 600 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.27 
 
 		 598 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  31.35 
 
 		 634 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.91 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  32.22 
 
 		 619 aa  234  5e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.76 
 
 		 1436 aa  234  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  28.52 
 
 		 596 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.19 
 
 		 1301 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  32.85 
 
 		 669 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 615 aa  233  8.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  31.81 
 
 		 620 aa  233  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  30.63 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  27.67 
 
 		 631 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.8 
 
 		 614 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.5 
 
 		 598 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.47 
 
 		 577 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1549  ABC transporter related  33.33 
 
 		 613 aa  232  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0873918  normal  0.0393082 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  28.6 
 
 		 590 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  29.11 
 
 		 596 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  32.25 
 
 		 641 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.6 
 
 		 598 aa  231  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  32.01 
 
 		 616 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.19 
 
 		 596 aa  230  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.39 
 
 		 587 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  28.73 
 
 		 607 aa  230  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.82 
 
 		 575 aa  230  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.92 
 
 		 608 aa  230  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.68 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.18 
 
 		 571 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>