More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11630 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 610 aa  1185    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  41.64 
 
 		 668 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  41.38 
 
 		 608 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  43.28 
 
 		 610 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 601 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  42.11 
 
 		 595 aa  360  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 609 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  44.84 
 
 		 628 aa  357  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 578 aa  349  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  40.2 
 
 		 574 aa  342  9e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  35.49 
 
 		 595 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  39.91 
 
 		 666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  37.19 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  37.91 
 
 		 577 aa  302  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  36.69 
 
 		 579 aa  300  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.49 
 
 		 580 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.73 
 
 		 601 aa  295  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.25 
 
 		 626 aa  293  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  38.37 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 579 aa  266  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  35.75 
 
 		 590 aa  257  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  37.22 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.5 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.32 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.32 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.29 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  31.75 
 
 		 606 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  29.4 
 
 		 625 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  35.42 
 
 		 579 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  29.04 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.11 
 
 		 622 aa  237  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  31.35 
 
 		 601 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.19 
 
 		 598 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 620 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  30.2 
 
 		 619 aa  233  6e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31 
 
 		 591 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.34 
 
 		 589 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  30.23 
 
 		 601 aa  233  9e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 646 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.3 
 
 		 579 aa  231  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  25.34 
 
 		 600 aa  230  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  26.99 
 
 		 582 aa  230  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  28.6 
 
 		 587 aa  230  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.27 
 
 		 614 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  32.53 
 
 		 628 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  25.68 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  28.21 
 
 		 629 aa  228  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  27.8 
 
 		 614 aa  228  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.52 
 
 		 608 aa  228  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.42 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  28.88 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.31 
 
 		 605 aa  224  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  33.57 
 
 		 642 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  30.85 
 
 		 619 aa  223  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  29.26 
 
 		 597 aa  223  7e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  30.35 
 
 		 622 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  26.23 
 
 		 628 aa  223  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.89 
 
 		 640 aa  223  8e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  31.31 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.75 
 
 		 606 aa  223  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  31.01 
 
 		 651 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  27.45 
 
 		 628 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  28.03 
 
 		 596 aa  222  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.55 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  30.7 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  32.02 
 
 		 636 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  27.82 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.38 
 
 		 581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  30.23 
 
 		 601 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.83 
 
 		 597 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  33.2 
 
 		 658 aa  220  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  26.83 
 
 		 597 aa  220  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  28.65 
 
 		 587 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  220  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  220  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  31.51 
 
 		 626 aa  220  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.65 
 
 		 627 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  30.32 
 
 		 594 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.05 
 
 		 601 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  32.51 
 
 		 654 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  32.41 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.14 
 
 		 571 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  29.11 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  31.54 
 
 		 627 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.65 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.03 
 
 		 634 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.31 
 
 		 571 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.31 
 
 		 571 aa  218  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  28.32 
 
 		 572 aa  218  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  30.43 
 
 		 611 aa  218  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.02 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.02 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.02 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  32.59 
 
 		 606 aa  217  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  25.59 
 
 		 631 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>