More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3183 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  75.81 
 
 		 614 aa  940    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  67.24 
 
 		 600 aa  757    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  64.12 
 
 		 609 aa  717    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.41 
 
 		 635 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 590 aa  685    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  56.63 
 
 		 620 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  100 
 
 		 615 aa  1223    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  61.47 
 
 		 593 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  58.25 
 
 		 602 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  60.62 
 
 		 589 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  60.57 
 
 		 609 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  66.1 
 
 		 590 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.34 
 
 		 618 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  54.45 
 
 		 593 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.72 
 
 		 626 aa  594  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  57.31 
 
 		 588 aa  585  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 595 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  54.07 
 
 		 581 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  57 
 
 		 616 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  47.39 
 
 		 615 aa  523  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.68 
 
 		 984 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.68 
 
 		 597 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  37.68 
 
 		 610 aa  333  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.68 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.68 
 
 		 610 aa  332  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  37.63 
 
 		 619 aa  330  6e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  38.92 
 
 		 605 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 636 aa  323  8e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.55 
 
 		 1257 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 1218 aa  321  3e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  31.7 
 
 		 593 aa  314  2.9999999999999996e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.94 
 
 		 617 aa  313  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  37.81 
 
 		 606 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 614 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  30.91 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  34.69 
 
 		 615 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 		 605 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.61 
 
 		 1522 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  34.32 
 
 		 610 aa  306  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  29.66 
 
 		 597 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3344  ABC transporter related  37.06 
 
 		 615 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.32 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.44 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.14 
 
 		 598 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.44 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.25 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.85 
 
 		 1284 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 571 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.63 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.63 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.63 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 571 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.63 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.44 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.75 
 
 		 571 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.63 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.06 
 
 		 598 aa  299  9e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.61 
 
 		 598 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  33.55 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.99 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.86 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  35.83 
 
 		 615 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.66 
 
 		 587 aa  297  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.23 
 
 		 608 aa  297  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.27 
 
 		 571 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.82 
 
 		 614 aa  296  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 618 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  35.28 
 
 		 612 aa  295  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.68 
 
 		 1301 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.36 
 
 		 608 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 606 aa  293  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.25 
 
 		 1436 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  34.64 
 
 		 609 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.07 
 
 		 618 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  31.5 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  32.25 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  29.9 
 
 		 618 aa  290  7e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  33.62 
 
 		 609 aa  289  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  35.76 
 
 		 629 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.7 
 
 		 587 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  33.11 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  31.24 
 
 		 764 aa  287  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.74 
 
 		 598 aa  287  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  32.06 
 
 		 602 aa  287  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.43 
 
 		 608 aa  287  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.28 
 
 		 572 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.56 
 
 		 606 aa  286  8e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.38 
 
 		 572 aa  286  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  32.42 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.7 
 
 		 671 aa  286  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  34.65 
 
 		 625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  31.77 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.17 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 596 aa  283  5.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 586 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 		 632 aa  282  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>