More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1128 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  65.53 
 
 
581 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  100 
 
 
579 aa  1110    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  59.86 
 
 
611 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  54.83 
 
 
579 aa  547  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
581 aa  531  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  52.82 
 
 
581 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
577 aa  527  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  51.98 
 
 
577 aa  521  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  49.48 
 
 
595 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.34 
 
 
601 aa  497  1e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  52.77 
 
 
590 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.77 
 
 
580 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  49.31 
 
 
579 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
646 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  47.09 
 
 
579 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  41.87 
 
 
668 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
578 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.73 
 
 
608 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  39.15 
 
 
574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  39.86 
 
 
610 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.45 
 
 
581 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.66 
 
 
610 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  35.51 
 
 
610 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  38.38 
 
 
666 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.97 
 
 
626 aa  262  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.32 
 
 
610 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.32 
 
 
610 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
601 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.13 
 
 
595 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  29.64 
 
 
640 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  35.06 
 
 
605 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  36.67 
 
 
609 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  39.06 
 
 
628 aa  238  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.27 
 
 
636 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  31.93 
 
 
606 aa  235  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  34.62 
 
 
606 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  30.49 
 
 
598 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  28.07 
 
 
631 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  32.73 
 
 
652 aa  230  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  31.3 
 
 
666 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.69 
 
 
637 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  32.65 
 
 
672 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  33.94 
 
 
606 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  34.72 
 
 
634 aa  224  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  26.17 
 
 
628 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.72 
 
 
621 aa  223  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.91 
 
 
575 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  29.84 
 
 
636 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3355  ABC transporter transmembrane region  30.88 
 
 
672 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
623 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  27.44 
 
 
671 aa  218  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.65 
 
 
608 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  25.09 
 
 
636 aa  217  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  25.4 
 
 
618 aa  216  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4565  ABC transporter related protein  29.46 
 
 
811 aa  216  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  30.44 
 
 
596 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.69 
 
 
637 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  29.55 
 
 
590 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  30.42 
 
 
620 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
595 aa  214  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  34.44 
 
 
620 aa  214  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  27.53 
 
 
600 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0008  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.69 
 
 
590 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.56 
 
 
614 aa  213  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0632  ABC transporter related  26.35 
 
 
627 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000138472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.9 
 
 
1284 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 
587 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 
587 aa  212  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  32.57 
 
 
625 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  32.77 
 
 
626 aa  213  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  27.8 
 
 
587 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
615 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.77 
 
 
595 aa  213  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  26.53 
 
 
587 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.53 
 
 
587 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3638  ABC transporter, transmembrane region  30.74 
 
 
665 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.53 
 
 
587 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.71 
 
 
587 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.34 
 
 
632 aa  211  4e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  35 
 
 
619 aa  211  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  33.05 
 
 
642 aa  210  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.19 
 
 
597 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.37 
 
 
634 aa  210  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.78 
 
 
598 aa  210  7e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  28.26 
 
 
594 aa  210  7e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
598 aa  209  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  28.16 
 
 
586 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  23.83 
 
 
625 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  28.62 
 
 
587 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  27.24 
 
 
587 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  24.83 
 
 
646 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  32.72 
 
 
687 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  33.13 
 
 
1522 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.57 
 
 
556 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  30.43 
 
 
608 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  30.3 
 
 
575 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.39 
 
 
586 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.83 
 
 
627 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  30.3 
 
 
641 aa  209  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  31.59 
 
 
592 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>