More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13891 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  53.75 
 
 
547 aa  651    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  56.94 
 
 
578 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  53.92 
 
 
548 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  67.33 
 
 
552 aa  759    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  71.9 
 
 
581 aa  813    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  63.15 
 
 
580 aa  776    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  53.35 
 
 
568 aa  661    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  57.29 
 
 
578 aa  693    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  100 
 
 
592 aa  1179    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  54.48 
 
 
548 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  48.71 
 
 
582 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  45.99 
 
 
550 aa  509  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  44.13 
 
 
580 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  44.13 
 
 
580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  43.21 
 
 
575 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  44.68 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  43.77 
 
 
578 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  47.25 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.7 
 
 
577 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.06 
 
 
556 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.93 
 
 
575 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
598 aa  345  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.79 
 
 
571 aa  345  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.8 
 
 
582 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.27 
 
 
572 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.84 
 
 
589 aa  334  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.75 
 
 
585 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  35.08 
 
 
571 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.1 
 
 
580 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.85 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.91 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.06 
 
 
601 aa  321  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.79 
 
 
596 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 
616 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.93 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.93 
 
 
578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.63 
 
 
580 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.93 
 
 
580 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.86 
 
 
575 aa  312  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.92 
 
 
587 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  35.15 
 
 
624 aa  310  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  35.39 
 
 
595 aa  310  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.25 
 
 
598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.09 
 
 
617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.63 
 
 
614 aa  309  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.39 
 
 
596 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
620 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.55 
 
 
587 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.44 
 
 
566 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  35.39 
 
 
601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.76 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.8 
 
 
598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
594 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  32.59 
 
 
612 aa  306  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  38.74 
 
 
628 aa  306  7e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.44 
 
 
566 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.02 
 
 
584 aa  306  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  30.98 
 
 
582 aa  306  9.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.69 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  34.84 
 
 
572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.84 
 
 
572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  34.84 
 
 
572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.04 
 
 
588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.18 
 
 
575 aa  304  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  34.97 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.57 
 
 
591 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.53 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.97 
 
 
571 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  33.51 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.97 
 
 
571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.97 
 
 
571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.97 
 
 
571 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.53 
 
 
597 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.85 
 
 
605 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.97 
 
 
571 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  32.43 
 
 
583 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  34.49 
 
 
601 aa  302  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
613 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
586 aa  302  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.76 
 
 
571 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
585 aa  302  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36.84 
 
 
586 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 
586 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2826  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  34.94 
 
 
604 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.070781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  34.07 
 
 
595 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.76 
 
 
571 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1770  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.56 
 
 
607 aa  301  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0549134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.99 
 
 
598 aa  300  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  35.84 
 
 
597 aa  300  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 
611 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.76 
 
 
571 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.99 
 
 
598 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.18 
 
 
597 aa  300  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.2 
 
 
607 aa  299  8e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  33.14 
 
 
613 aa  299  9e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.54 
 
 
600 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.76 
 
 
571 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.56 
 
 
584 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 
586 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.57 
 
 
591 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>