More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_10431 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  100 
 
 
548 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  56.83 
 
 
580 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  89.78 
 
 
568 aa  1003    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  76.19 
 
 
548 aa  873    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  53.92 
 
 
592 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  90.49 
 
 
547 aa  1014    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  55.47 
 
 
578 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  51.37 
 
 
581 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  53.93 
 
 
578 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  49.73 
 
 
552 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  43.59 
 
 
582 aa  478  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  44.22 
 
 
550 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  41.89 
 
 
575 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  43.96 
 
 
578 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  40.9 
 
 
578 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  40.94 
 
 
580 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  40.64 
 
 
580 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  42.91 
 
 
546 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.94 
 
 
572 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  37.47 
 
 
575 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.83 
 
 
556 aa  316  7e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.27 
 
 
585 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.21 
 
 
571 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.91 
 
 
579 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.06 
 
 
598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.15 
 
 
596 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
575 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.64 
 
 
577 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.12 
 
 
594 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.91 
 
 
627 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.38 
 
 
580 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  34.23 
 
 
586 aa  299  7e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.58 
 
 
578 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.58 
 
 
578 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.16 
 
 
578 aa  296  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 
586 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  35.31 
 
 
586 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  33.4 
 
 
571 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.19 
 
 
580 aa  293  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0152  ABC transporter related  35.68 
 
 
613 aa  293  6e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.273872  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  38.6 
 
 
468 aa  293  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.17 
 
 
588 aa  293  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  32.82 
 
 
601 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
586 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  33.46 
 
 
624 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  36.29 
 
 
612 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  33.66 
 
 
595 aa  289  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.3 
 
 
582 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.52 
 
 
611 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 
586 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 
598 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  30.97 
 
 
614 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.51 
 
 
601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
578 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  33.09 
 
 
586 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.78 
 
 
598 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  32.82 
 
 
583 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.78 
 
 
598 aa  287  4e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.78 
 
 
598 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
586 aa  287  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.46 
 
 
580 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.27 
 
 
586 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
586 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.75 
 
 
579 aa  286  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  34.5 
 
 
598 aa  286  7e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.03 
 
 
581 aa  286  7e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
586 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.65 
 
 
611 aa  286  8e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  32.59 
 
 
609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.59 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.63 
 
 
591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  35.18 
 
 
610 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.78 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.93 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.87 
 
 
597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.65 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  33.47 
 
 
588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  33.15 
 
 
589 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.39 
 
 
575 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.41 
 
 
598 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.46 
 
 
611 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.06 
 
 
588 aa  281  1e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  34.76 
 
 
587 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.51 
 
 
590 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  33.07 
 
 
594 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.64 
 
 
596 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.2 
 
 
586 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.89 
 
 
628 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.56 
 
 
587 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  36.1 
 
 
598 aa  281  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  35.26 
 
 
575 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.22 
 
 
609 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.22 
 
 
591 aa  281  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  35.26 
 
 
575 aa  281  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  32.88 
 
 
595 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.05 
 
 
601 aa  280  4e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.59 
 
 
582 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.53 
 
 
1019 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>