More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0303 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0303  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 575 aa  1160    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0681  ABC transporter related  87.65 
 
 		 575 aa  1005    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0666  ABC transporter related  87.65 
 
 		 575 aa  1005    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1789  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  45.14 
 
 		 586 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1961  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.32 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1990  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.14 
 
 		 586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.43486e-48 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1771  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 		 586 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2061  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.96 
 
 		 586 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.96 
 
 		 586 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.487064  hitchhiker  1.72644e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1823  ABC transporter related  45.5 
 
 		 586 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2040  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.95 
 
 		 586 aa  511  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0635761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  43.34 
 
 		 583 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1345  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40 
 
 		 599 aa  445  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0100192  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  39.93 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  38.61 
 
 		 600 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.65 
 
 		 601 aa  353  7e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1815  ABC transporter  46.58 
 
 		 370 aa  349  7e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.51 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  36 
 
 		 586 aa  333  7.000000000000001e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.87 
 
 		 605 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  36.67 
 
 		 598 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.13 
 
 		 556 aa  330  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  35.2 
 
 		 586 aa  329  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.1 
 
 		 601 aa  328  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  33.93 
 
 		 596 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.43 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 618 aa  324  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  35.12 
 
 		 575 aa  324  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.98 
 
 		 578 aa  323  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.1 
 
 		 598 aa  323  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.15 
 
 		 597 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.46 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.41 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.41 
 
 		 578 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.46 
 
 		 571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.46 
 
 		 571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 		 571 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.46 
 
 		 571 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.11 
 
 		 597 aa  320  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.05 
 
 		 571 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 598 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 		 598 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.93 
 
 		 571 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.93 
 
 		 571 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.81 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.46 
 
 		 575 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.41 
 
 		 605 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.08 
 
 		 589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.44 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  34.44 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  34.68 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.44 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  32.98 
 
 		 582 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.43 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.58 
 
 		 585 aa  309  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.52 
 
 		 614 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.98 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.15 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  32.8 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.63 
 
 		 598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33020  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320333  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3474  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.68 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.85 
 
 		 594 aa  304  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  34.35 
 
 		 618 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.23 
 
 		 598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  32.18 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.1 
 
 		 641 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  32.92 
 
 		 588 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.83 
 
 		 622 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.71 
 
 		 586 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  34.48 
 
 		 575 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  34.4 
 
 		 603 aa  303  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.7 
 
 		 586 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1362  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.27 
 
 		 580 aa  302  9e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.68 
 
 		 660 aa  302  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  31 
 
 		 639 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.46 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.26 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.76 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.08 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.8 
 
 		 650 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  33.33 
 
 		 608 aa  301  3e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 619 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.44 
 
 		 600 aa  300  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  32.79 
 
 		 578 aa  300  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.47 
 
 		 639 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.67 
 
 		 589 aa  299  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32 
 
 		 597 aa  299  9e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.32 
 
 		 632 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  33.33 
 
 		 578 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.01 
 
 		 597 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.59 
 
 		 586 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.66 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.52 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>