More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5068 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  100 
 
 
666 aa  1247    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  60.28 
 
 
668 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  48.14 
 
 
608 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
578 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
601 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  42.24 
 
 
595 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.06 
 
 
610 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
609 aa  359  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  41.6 
 
 
610 aa  347  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  45.07 
 
 
628 aa  333  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
579 aa  326  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  37.54 
 
 
611 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  38.78 
 
 
581 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  36.83 
 
 
577 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
579 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  41.44 
 
 
590 aa  296  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.75 
 
 
580 aa  295  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  36.47 
 
 
577 aa  280  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.7 
 
 
601 aa  264  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
646 aa  264  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  36.68 
 
 
579 aa  254  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
579 aa  249  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
581 aa  243  6e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  31.04 
 
 
610 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  31.04 
 
 
610 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  31.04 
 
 
610 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.11 
 
 
598 aa  223  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  54.47 
 
 
574 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.56 
 
 
634 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  47.54 
 
 
595 aa  219  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.84 
 
 
622 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
632 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  31.35 
 
 
629 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  31.5 
 
 
634 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  30.81 
 
 
640 aa  214  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  27.32 
 
 
648 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.73 
 
 
608 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.1 
 
 
585 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.35 
 
 
626 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  31.52 
 
 
632 aa  211  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  30.82 
 
 
642 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  30.48 
 
 
627 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  30.2 
 
 
658 aa  209  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  31.81 
 
 
640 aa  208  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  33.06 
 
 
1436 aa  207  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  31.74 
 
 
605 aa  207  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  32.3 
 
 
633 aa  206  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  31.97 
 
 
606 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  31.79 
 
 
616 aa  206  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  28.03 
 
 
635 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  26.34 
 
 
617 aa  204  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  30.61 
 
 
628 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  29 
 
 
610 aa  205  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  28.3 
 
 
614 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  29.84 
 
 
615 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  29.81 
 
 
606 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  29.87 
 
 
658 aa  203  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 
611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  31.09 
 
 
611 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0972  ABC transporter transmembrane region  26.73 
 
 
691 aa  200  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0935036 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  30.67 
 
 
641 aa  200  6e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 
595 aa  200  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  32.97 
 
 
1218 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.73 
 
 
605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.27 
 
 
611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.13 
 
 
632 aa  199  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.67 
 
 
637 aa  198  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.32 
 
 
637 aa  198  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  23.83 
 
 
636 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  32.11 
 
 
654 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  29.95 
 
 
640 aa  197  8.000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  30.15 
 
 
687 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  31.91 
 
 
631 aa  195  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  29.64 
 
 
608 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  23.84 
 
 
597 aa  194  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  29.71 
 
 
589 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  29.5 
 
 
625 aa  194  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  27.41 
 
 
614 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  29.01 
 
 
614 aa  193  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  29.63 
 
 
626 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 
614 aa  193  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  28.59 
 
 
642 aa  193  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  29.55 
 
 
636 aa  193  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  28.4 
 
 
639 aa  193  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  24.91 
 
 
609 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.44 
 
 
677 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  26.9 
 
 
607 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.85 
 
 
721 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  29.52 
 
 
631 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  27.16 
 
 
632 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  26.79 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  24.8 
 
 
620 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1500  ABC transporter related protein  23.73 
 
 
630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000079767  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  27.32 
 
 
634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
624 aa  191  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  29.25 
 
 
637 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  29.21 
 
 
622 aa  191  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  32.09 
 
 
1301 aa  191  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.66 
 
 
566 aa  191  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>