More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  70.21 
 
 		 579 aa  793    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  69.57 
 
 		 577 aa  782    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 580 aa  1139    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  67.25 
 
 		 577 aa  749    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  61.59 
 
 		 595 aa  709    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  54.01 
 
 		 611 aa  579  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.69 
 
 		 601 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  55.75 
 
 		 590 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  53.79 
 
 		 581 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  50.77 
 
 		 579 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  49.22 
 
 		 581 aa  488  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  49.47 
 
 		 579 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  46.89 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 646 aa  428  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.83 
 
 		 581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  39.48 
 
 		 608 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  37.25 
 
 		 668 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  38.36 
 
 		 610 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.92 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.56 
 
 		 626 aa  295  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  39.86 
 
 		 601 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  37.77 
 
 		 628 aa  288  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  35.74 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  35.61 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 578 aa  276  6e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  34.35 
 
 		 610 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.11 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.11 
 
 		 610 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  33.52 
 
 		 605 aa  250  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 614 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 		 606 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.14 
 
 		 609 aa  240  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  29.55 
 
 		 575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.5 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.4 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.57 
 
 		 598 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.32 
 
 		 598 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 615 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  32.51 
 
 		 634 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  25.69 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  33.39 
 
 		 652 aa  231  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.04 
 
 		 670 aa  230  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 590 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  27.6 
 
 		 631 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  28.4 
 
 		 598 aa  229  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  32.6 
 
 		 615 aa  226  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.01 
 
 		 632 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.21 
 
 		 619 aa  226  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.05 
 
 		 598 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  28.52 
 
 		 600 aa  225  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.69 
 
 		 629 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0579  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.06 
 
 		 595 aa  224  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  29.1 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  26.05 
 
 		 618 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.06 
 
 		 614 aa  223  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  27.32 
 
 		 598 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  25.45 
 
 		 617 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  28.87 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  28.1 
 
 		 576 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.13 
 
 		 571 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  26.98 
 
 		 646 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  34.13 
 
 		 633 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.3 
 
 		 571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  28.75 
 
 		 587 aa  220  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.24 
 
 		 601 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  29.11 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.11 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.11 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.89 
 
 		 608 aa  220  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  27.74 
 
 		 598 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.74 
 
 		 598 aa  220  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 		 587 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.74 
 
 		 598 aa  220  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.47 
 
 		 616 aa  220  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.95 
 
 		 571 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 587 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.95 
 
 		 571 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  31.21 
 
 		 606 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.95 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.12 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.95 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.95 
 
 		 571 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.06 
 
 		 601 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  26.36 
 
 		 597 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  30.94 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  29.12 
 
 		 598 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.35 
 
 		 595 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.6 
 
 		 608 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.72 
 
 		 598 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  27.04 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  26.08 
 
 		 597 aa  217  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.22 
 
 		 591 aa  217  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  26.27 
 
 		 594 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  28.81 
 
 		 590 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  33.16 
 
 		 593 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  26.92 
 
 		 628 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.77 
 
 		 571 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>