More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3978 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  60.59 
 
 		 614 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  58.62 
 
 		 590 aa  636    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  61.19 
 
 		 600 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  63.95 
 
 		 589 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  63.71 
 
 		 593 aa  707    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 615 aa  699    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  100 
 
 		 590 aa  1167    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  55.88 
 
 		 602 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  59.56 
 
 		 609 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  56.75 
 
 		 620 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  54.62 
 
 		 635 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  57.54 
 
 		 609 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.19 
 
 		 618 aa  590  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.81 
 
 		 626 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  54.31 
 
 		 593 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  57.37 
 
 		 588 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  50.69 
 
 		 581 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  46.39 
 
 		 615 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 616 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  36.03 
 
 		 619 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  38.17 
 
 		 605 aa  324  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  35.66 
 
 		 610 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  35.66 
 
 		 610 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  35.85 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.28 
 
 		 984 aa  303  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 636 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 1218 aa  296  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  36.08 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  32.99 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  35.45 
 
 		 615 aa  286  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.41 
 
 		 1257 aa  286  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.29 
 
 		 597 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  36.76 
 
 		 652 aa  283  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 		 589 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  34.49 
 
 		 634 aa  278  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  29.38 
 
 		 584 aa  277  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  36.35 
 
 		 1436 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  30.81 
 
 		 593 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.22 
 
 		 596 aa  270  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  32.41 
 
 		 615 aa  268  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  34.58 
 
 		 634 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  31.87 
 
 		 764 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  34.51 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  29.71 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 594 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30 
 
 		 587 aa  267  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  33.73 
 
 		 612 aa  267  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3955  ABC transporter, transmembrane region  35.28 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375009  decreased coverage  0.0046772 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  31.86 
 
 		 590 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  32.76 
 
 		 602 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.62 
 
 		 601 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  34.12 
 
 		 1284 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.64 
 
 		 567 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.45 
 
 		 567 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  33.21 
 
 		 1301 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3941  ABC transporter, transmembrane region  35.1 
 
 		 631 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4015  ABC transporter, transmembrane region  35.1 
 
 		 631 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  32.18 
 
 		 773 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.11 
 
 		 1522 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  33 
 
 		 625 aa  263  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.41 
 
 		 588 aa  263  8.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  32.53 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  33.4 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  36.24 
 
 		 625 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  31.83 
 
 		 607 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  31.85 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  29.2 
 
 		 589 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.42 
 
 		 629 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  31.45 
 
 		 671 aa  261  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.98 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  34.64 
 
 		 616 aa  261  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  34.74 
 
 		 633 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.34 
 
 		 592 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  31.13 
 
 		 622 aa  260  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.77 
 
 		 610 aa  259  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.23 
 
 		 602 aa  259  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.56 
 
 		 605 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.95 
 
 		 567 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.86 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  34.06 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  31.13 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.71 
 
 		 600 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  32.22 
 
 		 608 aa  258  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  32.02 
 
 		 640 aa  257  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  32.77 
 
 		 595 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.32 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.66 
 
 		 582 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  31.94 
 
 		 608 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.49 
 
 		 598 aa  256  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.01 
 
 		 571 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  31.08 
 
 		 590 aa  256  8e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.01 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.01 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.01 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.07 
 
 		 598 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.01 
 
 		 571 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.36 
 
 		 572 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>