More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3763 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  100 
 
 		 984 aa  1903    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  42.35 
 
 		 589 aa  366  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  43.17 
 
 		 614 aa  364  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  44.36 
 
 		 600 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 615 aa  353  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  43.98 
 
 		 613 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  43.11 
 
 		 602 aa  347  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 609 aa  333  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  41.67 
 
 		 597 aa  332  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 608 aa  328  4.0000000000000003e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  41.5 
 
 		 602 aa  323  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  43.29 
 
 		 609 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  41.43 
 
 		 589 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  41.63 
 
 		 593 aa  322  3e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  43.02 
 
 		 625 aa  321  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  41.71 
 
 		 610 aa  321  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 590 aa  321  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 591 aa  321  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  40.2 
 
 		 620 aa  320  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 595 aa  317  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.72 
 
 		 635 aa  314  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  43.17 
 
 		 588 aa  313  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 671 aa  313  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 590 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  43.26 
 
 		 625 aa  312  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.91 
 
 		 618 aa  308  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.73 
 
 		 606 aa  308  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  38.45 
 
 		 615 aa  305  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  39.64 
 
 		 726 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  41.01 
 
 		 605 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  40.04 
 
 		 593 aa  297  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.27 
 
 		 626 aa  292  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  42.62 
 
 		 638 aa  290  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  41.22 
 
 		 581 aa  287  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 635 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.64 
 
 		 617 aa  285  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  39.78 
 
 		 608 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 616 aa  277  7e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  35.19 
 
 		 584 aa  257  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.25 
 
 		 730 aa  237  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.72 
 
 		 1257 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  33.85 
 
 		 1230 aa  211  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 636 aa  211  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.25 
 
 		 1522 aa  210  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  33.59 
 
 		 1436 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  26.29 
 
 		 598 aa  207  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  29.52 
 
 		 615 aa  206  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  29.45 
 
 		 576 aa  204  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 1218 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  33.27 
 
 		 1284 aa  203  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  33.66 
 
 		 1301 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.72 
 
 		 567 aa  199  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4037  ABC transporter related protein  31.46 
 
 		 764 aa  198  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.238544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  32.91 
 
 		 641 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.18 
 
 		 571 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.55 
 
 		 589 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  31.77 
 
 		 651 aa  196  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  30.97 
 
 		 567 aa  196  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  30.77 
 
 		 567 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1554  ABC transporter related  32.19 
 
 		 612 aa  196  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138935  hitchhiker  0.00285078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2358  ABC transporter related  28.17 
 
 		 619 aa  195  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  30.68 
 
 		 610 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.3 
 
 		 609 aa  194  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  31.3 
 
 		 610 aa  194  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.23 
 
 		 605 aa  194  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.98 
 
 		 571 aa  194  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.72 
 
 		 606 aa  194  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.88 
 
 		 591 aa  194  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.18 
 
 		 571 aa  194  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 650 aa  193  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.77 
 
 		 571 aa  194  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  31.55 
 
 		 638 aa  193  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  29.55 
 
 		 582 aa  192  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  30.28 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  32.04 
 
 		 650 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  30.28 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  32.04 
 
 		 650 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  30.26 
 
 		 610 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  29.68 
 
 		 587 aa  192  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  29.55 
 
 		 582 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.57 
 
 		 571 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 1332 aa  192  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  28.1 
 
 		 768 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  29.67 
 
 		 600 aa  191  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  27.7 
 
 		 594 aa  190  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  42.91 
 
 		 632 aa  190  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  31.5 
 
 		 592 aa  190  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  28.82 
 
 		 644 aa  190  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 620 aa  189  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  30.27 
 
 		 603 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  26.79 
 
 		 572 aa  189  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  29.51 
 
 		 603 aa  189  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.94 
 
 		 577 aa  189  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  34.11 
 
 		 1231 aa  189  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>