More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4361 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  100 
 
 		 581 aa  1123    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  55.63 
 
 		 614 aa  610  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  54.31 
 
 		 615 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  55.19 
 
 		 620 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  57.85 
 
 		 609 aa  588  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  58.42 
 
 		 593 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.91 
 
 		 635 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.12 
 
 		 618 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  57.57 
 
 		 590 aa  571  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 609 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  53.95 
 
 		 602 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  56.67 
 
 		 595 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  56.62 
 
 		 588 aa  544  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  50.69 
 
 		 590 aa  541  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  57.82 
 
 		 616 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  54.17 
 
 		 593 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  52.78 
 
 		 589 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  48.01 
 
 		 615 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49 
 
 		 626 aa  495  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.99 
 
 		 1257 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.61 
 
 		 610 aa  320  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.43 
 
 		 610 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.43 
 
 		 610 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 1218 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  41.19 
 
 		 1436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  37.48 
 
 		 605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 614 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  37.02 
 
 		 619 aa  308  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 598 aa  297  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  40.57 
 
 		 984 aa  296  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.97 
 
 		 1284 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  34.18 
 
 		 615 aa  293  7e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  37.83 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  36.38 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 596 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.67 
 
 		 1321 aa  288  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  33.15 
 
 		 636 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.5 
 
 		 608 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  36.22 
 
 		 610 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  33.04 
 
 		 608 aa  280  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  36.82 
 
 		 615 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  37.61 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  36.84 
 
 		 1301 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.3 
 
 		 621 aa  274  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  35.1 
 
 		 606 aa  274  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  38.9 
 
 		 634 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 600 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  34.34 
 
 		 622 aa  273  6e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.91 
 
 		 567 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  36.63 
 
 		 623 aa  272  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  30.88 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.68 
 
 		 589 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0911  ABC transporter related  36.02 
 
 		 640 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0397453  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  35.91 
 
 		 567 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.94 
 
 		 1522 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  34.4 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  39.02 
 
 		 633 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.8 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3822  ABC transporter transmembrane region  37.48 
 
 		 605 aa  270  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.568746  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.96 
 
 		 580 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.38 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.78 
 
 		 598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.03 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.68 
 
 		 610 aa  267  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.87 
 
 		 598 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  30 
 
 		 605 aa  266  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  30.34 
 
 		 600 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  30.48 
 
 		 594 aa  266  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.13 
 
 		 598 aa  264  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  30.13 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.13 
 
 		 598 aa  264  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.54 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.43 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.86 
 
 		 629 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.13 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  29.18 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  32.92 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3551  ABC transporter related  35.85 
 
 		 632 aa  261  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  30.07 
 
 		 597 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0738  ABC transporter related  31.76 
 
 		 614 aa  260  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  34.84 
 
 		 782 aa  260  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.03 
 
 		 721 aa  260  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.63 
 
 		 572 aa  260  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.47 
 
 		 614 aa  260  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.53 
 
 		 632 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.82 
 
 		 592 aa  259  8e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  33.52 
 
 		 617 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  35.17 
 
 		 808 aa  259  1e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  37.28 
 
 		 672 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  28.65 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.49 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  31.91 
 
 		 637 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 572 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  30.81 
 
 		 609 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  40 
 
 		 1231 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>