More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1445 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  66.67 
 
 
614 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  64.12 
 
 
615 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3227  ABC transporter related protein  61.88 
 
 
609 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.393011  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3978  ABC transporter related protein  57.54 
 
 
590 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1445  ABC transporter-like protein  100 
 
 
609 aa  1191    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2929  ABC transporter related protein  72.77 
 
 
590 aa  777    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  0.358264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5717  ABC transporter related  60.84 
 
 
620 aa  662    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3033  ABC transporter related  57.58 
 
 
602 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  72.41 
 
 
600 aa  795    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20800  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.95 
 
 
635 aa  631  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.464481  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3406  ABC transporter related  58.62 
 
 
593 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169933  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1926  ABC transporter related  60.56 
 
 
588 aa  631  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3180  ABC transporter related  58.38 
 
 
589 aa  617  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2230  ABC transporter related  56.55 
 
 
593 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  55.88 
 
 
618 aa  607  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.479998  normal  0.0267692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4361  ABC transporter related  57.85 
 
 
581 aa  597  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1494  ABC transporter related protein  57.31 
 
 
595 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.648483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27250  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.57 
 
 
626 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1994  ABC transporter related protein  57.56 
 
 
616 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0769116  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1210  ABC transporter related  48.13 
 
 
615 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  39.86 
 
 
619 aa  342  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.85 
 
 
1257 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  43.33 
 
 
984 aa  337  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
1218 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  38.63 
 
 
610 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  38.45 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  38.45 
 
 
610 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0740  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
615 aa  324  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
636 aa  320  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.99 
 
 
1522 aa  320  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  40.61 
 
 
1436 aa  319  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.5 
 
 
608 aa  320  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.39 
 
 
597 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.7 
 
 
597 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  38.16 
 
 
605 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.21 
 
 
617 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  38.49 
 
 
606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  38.39 
 
 
606 aa  309  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.03 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.35 
 
 
1284 aa  308  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.66 
 
 
764 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  37.93 
 
 
773 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.26 
 
 
637 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  38.22 
 
 
1301 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  36.91 
 
 
615 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.62 
 
 
598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  39.39 
 
 
608 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
600 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  33.59 
 
 
598 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  31.79 
 
 
636 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.42 
 
 
598 aa  299  9e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  32.42 
 
 
598 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
598 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.42 
 
 
598 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.41 
 
 
609 aa  299  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  34.52 
 
 
614 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.42 
 
 
598 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.16 
 
 
567 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 
598 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.16 
 
 
567 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.62 
 
 
598 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  33.17 
 
 
637 aa  297  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38 
 
 
601 aa  297  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  32.49 
 
 
605 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.62 
 
 
598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.82 
 
 
1321 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.34 
 
 
598 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  37.32 
 
 
614 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.27 
 
 
587 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
571 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
606 aa  294  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  32.95 
 
 
625 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.52 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.52 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.69 
 
 
598 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  32.43 
 
 
618 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
596 aa  293  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.09 
 
 
594 aa  293  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.52 
 
 
571 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.36 
 
 
598 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  38.6 
 
 
616 aa  293  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  32.81 
 
 
598 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.12 
 
 
617 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  37.93 
 
 
591 aa  292  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.93 
 
 
575 aa  292  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.34 
 
 
567 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  34.21 
 
 
619 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.34 
 
 
571 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  35.47 
 
 
608 aa  292  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
586 aa  291  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.34 
 
 
571 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.66 
 
 
618 aa  290  4e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 
571 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.61 
 
 
588 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  34.24 
 
 
671 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  30.34 
 
 
571 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.34 
 
 
571 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  31.49 
 
 
618 aa  290  8e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.4 
 
 
593 aa  289  9e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>