More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3228 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  59.69 
 
 		 613 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  63.39 
 
 		 602 aa  677    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  100 
 
 		 591 aa  1137    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  57.44 
 
 		 609 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  60.44 
 
 		 608 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  60.64 
 
 		 625 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  54.87 
 
 		 671 aa  599  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  61.5 
 
 		 625 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  55.19 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  57.04 
 
 		 597 aa  594  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  55.32 
 
 		 726 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  54.73 
 
 		 638 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.24 
 
 		 617 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  55.21 
 
 		 610 aa  535  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  54.99 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  50.09 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.68 
 
 		 606 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.17 
 
 		 730 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  51.6 
 
 		 608 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  43.01 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  31.85 
 
 		 606 aa  288  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  42.45 
 
 		 984 aa  287  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.92 
 
 		 594 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.17 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  31.19 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  30.77 
 
 		 593 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.86 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.44 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  29.05 
 
 		 585 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.52 
 
 		 586 aa  259  7e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  36.56 
 
 		 1284 aa  259  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.63 
 
 		 579 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.42 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.26 
 
 		 588 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  29.12 
 
 		 604 aa  257  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  29.12 
 
 		 589 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.59 
 
 		 581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 		 600 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.82 
 
 		 611 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.69 
 
 		 577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  32.58 
 
 		 604 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  31.7 
 
 		 587 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.49 
 
 		 586 aa  253  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 604 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  29.3 
 
 		 592 aa  253  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  37.38 
 
 		 631 aa  253  9.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  28.52 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.09 
 
 		 585 aa  252  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  39.96 
 
 		 1231 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.43 
 
 		 1522 aa  252  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.8 
 
 		 572 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.49 
 
 		 1257 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  34.82 
 
 		 583 aa  250  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  30.72 
 
 		 572 aa  249  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.85 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  31.45 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  29.65 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  29.63 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  31.84 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  32.48 
 
 		 579 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.84 
 
 		 556 aa  246  9e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  35.98 
 
 		 612 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  35.6 
 
 		 1301 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.06 
 
 		 582 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  27.34 
 
 		 572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  31.84 
 
 		 577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  28.28 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.03 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  36.28 
 
 		 633 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  32.57 
 
 		 642 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.89 
 
 		 578 aa  243  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.98 
 
 		 582 aa  243  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1955  ABC transporter, transmembrane region  30.73 
 
 		 607 aa  243  7e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.464432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.13 
 
 		 582 aa  243  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.01 
 
 		 583 aa  243  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  31.43 
 
 		 584 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.63 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.12 
 
 		 641 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.9 
 
 		 577 aa  243  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.47 
 
 		 583 aa  242  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 574 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  29.79 
 
 		 588 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3976  cyclic nucleotide-binding protein  29.71 
 
 		 574 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  34.23 
 
 		 1230 aa  242  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  28.89 
 
 		 585 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  27.94 
 
 		 586 aa  241  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.75 
 
 		 573 aa  240  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3715  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.72 
 
 		 583 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000980876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.73 
 
 		 618 aa  240  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3696  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.12 
 
 		 583 aa  240  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000188932 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.38 
 
 		 636 aa  239  6.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  32.56 
 
 		 541 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  29.58 
 
 		 602 aa  239  9e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  28.92 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  28.92 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.5 
 
 		 627 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.92 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>