More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1157 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  58.24 
 
 		 613 aa  663    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  63.56 
 
 		 608 aa  716    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  66.88 
 
 		 671 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  100 
 
 		 638 aa  1248    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  60.07 
 
 		 602 aa  685    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  56.17 
 
 		 726 aa  638    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  57.45 
 
 		 597 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  54.28 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  53.21 
 
 		 609 aa  601  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  54.71 
 
 		 591 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  53.88 
 
 		 625 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  53.55 
 
 		 610 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  54.1 
 
 		 625 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.67 
 
 		 617 aa  540  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.78 
 
 		 605 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.07 
 
 		 730 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  48.3 
 
 		 635 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.69 
 
 		 606 aa  463  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  47.49 
 
 		 608 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  42.83 
 
 		 584 aa  427  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  31.3 
 
 		 594 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  39.11 
 
 		 984 aa  277  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  34.51 
 
 		 1522 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  30.37 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.13 
 
 		 606 aa  259  9e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.06 
 
 		 575 aa  252  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  32.24 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  37.97 
 
 		 1231 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.74 
 
 		 582 aa  248  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.56 
 
 		 596 aa  246  6.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 640 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  34.86 
 
 		 631 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 		 622 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.6 
 
 		 654 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.74 
 
 		 600 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  34.51 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  34.51 
 
 		 650 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  35.77 
 
 		 1284 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.98 
 
 		 586 aa  243  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  30.06 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 		 604 aa  243  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 578 aa  243  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 622 aa  243  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.17 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  27.21 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  28.99 
 
 		 596 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.08 
 
 		 583 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.84 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  27.26 
 
 		 585 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  34 
 
 		 641 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.55 
 
 		 577 aa  240  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  33.14 
 
 		 600 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.07 
 
 		 1257 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.41 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  30.51 
 
 		 585 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  31.56 
 
 		 589 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  28.44 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2125  lipid ABC transporter, ATP-binding/permease protein MsbA  28.17 
 
 		 602 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153506  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.44 
 
 		 628 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  31.11 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  32.78 
 
 		 603 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  29.22 
 
 		 581 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02160  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.52 
 
 		 608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 613 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  32.97 
 
 		 603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.67 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.11 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  28.23 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  31.93 
 
 		 591 aa  234  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33.59 
 
 		 640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  27.72 
 
 		 571 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  34.34 
 
 		 1321 aa  233  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  29.98 
 
 		 609 aa  233  9e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.77 
 
 		 627 aa  232  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  27.51 
 
 		 593 aa  232  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 579 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  27.06 
 
 		 556 aa  231  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  34.4 
 
 		 578 aa  232  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.22 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  31.58 
 
 		 618 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.49 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.95 
 
 		 587 aa  231  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.25 
 
 		 639 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 		 582 aa  231  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  33.27 
 
 		 577 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  28.09 
 
 		 580 aa  231  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  33.15 
 
 		 633 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.53 
 
 		 571 aa  230  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0531  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.38 
 
 		 603 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.140782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.64 
 
 		 614 aa  230  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 596 aa  229  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.82 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  32.95 
 
 		 1230 aa  229  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  28.18 
 
 		 577 aa  229  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  26.99 
 
 		 597 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  27.34 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.34 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.34 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  28.87 
 
 		 577 aa  229  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>