More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2881 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  63.62 
 
 
638 aa  689    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  62.23 
 
 
671 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  72.71 
 
 
613 aa  806    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  100 
 
 
608 aa  1171    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  58.54 
 
 
726 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  62.89 
 
 
597 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  71.84 
 
 
602 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  61.03 
 
 
625 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  61.17 
 
 
589 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  60.2 
 
 
591 aa  632  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  56.95 
 
 
609 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  61.63 
 
 
625 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  54.64 
 
 
610 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.31 
 
 
617 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.91 
 
 
606 aa  538  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
635 aa  521  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  50.76 
 
 
605 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.3 
 
 
730 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  51.27 
 
 
608 aa  488  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  44.88 
 
 
584 aa  457  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  43.17 
 
 
984 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  34.72 
 
 
586 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  30.33 
 
 
594 aa  283  5.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  32.02 
 
 
593 aa  280  4e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.23 
 
 
1257 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.7 
 
 
581 aa  275  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.13 
 
 
1522 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.73 
 
 
585 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  40.84 
 
 
1231 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.42 
 
 
582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  34.25 
 
 
577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.81 
 
 
596 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  37.78 
 
 
631 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
578 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  34.25 
 
 
577 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  27.96 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.06 
 
 
585 aa  267  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  36.56 
 
 
627 aa  267  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.15 
 
 
577 aa  267  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.09 
 
 
581 aa  266  1e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.67 
 
 
593 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.83 
 
 
622 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.27 
 
 
589 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  32.07 
 
 
586 aa  263  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  37.64 
 
 
1436 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  35.16 
 
 
654 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  30 
 
 
578 aa  263  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  29.47 
 
 
606 aa  261  2e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  32.39 
 
 
588 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.39 
 
 
579 aa  261  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  35.93 
 
 
641 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  30.12 
 
 
589 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.97 
 
 
1284 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  32.99 
 
 
591 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  35.56 
 
 
640 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3802  lipid A export ATP-binding protein  37.45 
 
 
615 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360172  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 
604 aa  257  5e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
628 aa  257  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.87 
 
 
606 aa  257  5e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  35.04 
 
 
636 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  35.88 
 
 
577 aa  256  6e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  29.1 
 
 
581 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.79 
 
 
587 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  35 
 
 
611 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  34.12 
 
 
641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  35.28 
 
 
650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  35.28 
 
 
650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  33.11 
 
 
626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 
611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.4 
 
 
627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  36.12 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  33.63 
 
 
601 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.48 
 
 
588 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.72 
 
 
571 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.72 
 
 
571 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  33.06 
 
 
627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  33.06 
 
 
627 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.81 
 
 
611 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.01 
 
 
639 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  38.91 
 
 
578 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  33.33 
 
 
583 aa  253  7e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
575 aa  253  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  29.03 
 
 
598 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.75 
 
 
585 aa  252  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 
1194 aa  252  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  35.95 
 
 
586 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.45 
 
 
611 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  35.79 
 
 
631 aa  252  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.3 
 
 
600 aa  252  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.83 
 
 
579 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.34 
 
 
571 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  34.7 
 
 
633 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.32 
 
 
571 aa  251  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.52 
 
 
571 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  30.48 
 
 
634 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.52 
 
 
571 aa  250  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.52 
 
 
571 aa  250  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.15 
 
 
571 aa  251  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.52 
 
 
571 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  33.57 
 
 
595 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>