More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1444 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  56.83 
 
 		 726 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 613 aa  1197    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  73.58 
 
 		 602 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  59.69 
 
 		 591 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  72.81 
 
 		 608 aa  775    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  59.07 
 
 		 625 aa  648    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  62.41 
 
 		 597 aa  685    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  62.37 
 
 		 589 aa  711    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  57.55 
 
 		 671 aa  657    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  59.08 
 
 		 638 aa  630  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  58.68 
 
 		 625 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  56.79 
 
 		 609 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  52.53 
 
 		 610 aa  568  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.14 
 
 		 617 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  53.78 
 
 		 635 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.51 
 
 		 606 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.4 
 
 		 730 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  48.74 
 
 		 605 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  49.58 
 
 		 608 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  43.32 
 
 		 584 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  43.34 
 
 		 984 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  37.8 
 
 		 1522 aa  287  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  30.28 
 
 		 585 aa  280  5e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.98 
 
 		 594 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  33.66 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  40.96 
 
 		 1231 aa  277  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  33.66 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  31.08 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  36.5 
 
 		 631 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  31.9 
 
 		 639 aa  266  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  31.95 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.25 
 
 		 579 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.97 
 
 		 1257 aa  265  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  32.26 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  37.72 
 
 		 1321 aa  264  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  34.26 
 
 		 588 aa  264  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  34.93 
 
 		 581 aa  263  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  37.03 
 
 		 1284 aa  263  8.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.48 
 
 		 593 aa  263  8.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  30.49 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  32.18 
 
 		 590 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  30.21 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  35.67 
 
 		 583 aa  260  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  32.68 
 
 		 582 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  32.03 
 
 		 634 aa  259  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  31.04 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  35.5 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  34.12 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  32.07 
 
 		 577 aa  258  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 578 aa  258  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.33 
 
 		 579 aa  258  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  30.84 
 
 		 598 aa  257  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  29.62 
 
 		 592 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  35.8 
 
 		 650 aa  257  5e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  35.8 
 
 		 650 aa  257  5e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.79 
 
 		 556 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.46 
 
 		 1194 aa  256  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  31.73 
 
 		 589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  38.33 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  36.03 
 
 		 641 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  33.33 
 
 		 596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  35.76 
 
 		 628 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  30.25 
 
 		 586 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  31.84 
 
 		 649 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1107  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.27 
 
 		 591 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349072  hitchhiker  0.00000399844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  36.35 
 
 		 1301 aa  253  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.36 
 
 		 585 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11298  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.82 
 
 		 631 aa  253  8.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  32.99 
 
 		 616 aa  253  9.000000000000001e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  37.61 
 
 		 582 aa  253  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.46 
 
 		 589 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  30.15 
 
 		 590 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  35.76 
 
 		 595 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.14 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  36.43 
 
 		 633 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  32.01 
 
 		 589 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  31.63 
 
 		 604 aa  251  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  32.13 
 
 		 666 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  30.7 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.13 
 
 		 596 aa  251  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 596 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  33.26 
 
 		 586 aa  251  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  30.56 
 
 		 632 aa  250  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  32.48 
 
 		 585 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  30.31 
 
 		 588 aa  250  6e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.34 
 
 		 702 aa  250  6e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 		 577 aa  250  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  32.52 
 
 		 575 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  32.69 
 
 		 634 aa  249  8e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.29 
 
 		 593 aa  249  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  31.35 
 
 		 596 aa  249  9e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  30.7 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.02 
 
 		 585 aa  249  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  30.02 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  32.99 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.61 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  36.34 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  28.57 
 
 		 572 aa  248  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 		 672 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>