More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0219 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  100 
 
 
582 aa  1173    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  52.1 
 
 
614 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  52.28 
 
 
613 aa  584  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  49.74 
 
 
595 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3581  ABC transporter related  50.09 
 
 
599 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.689947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.24 
 
 
597 aa  330  6e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
575 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
581 aa  320  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.57 
 
 
588 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  32.8 
 
 
581 aa  317  4e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  32.8 
 
 
588 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.18 
 
 
588 aa  312  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.05 
 
 
606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  34.85 
 
 
597 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.7 
 
 
579 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  36.75 
 
 
594 aa  309  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
620 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  32.03 
 
 
585 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.55 
 
 
594 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.21 
 
 
581 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.54 
 
 
584 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.68 
 
 
641 aa  303  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36 
 
 
596 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  36.31 
 
 
609 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.14 
 
 
584 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.78 
 
 
589 aa  300  5e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  36.53 
 
 
625 aa  300  6e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.05 
 
 
580 aa  300  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  35.75 
 
 
644 aa  299  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.93 
 
 
602 aa  298  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  35.75 
 
 
601 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.71 
 
 
566 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 
571 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 
566 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  33.39 
 
 
589 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.63 
 
 
600 aa  296  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 
571 aa  296  9e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  31.21 
 
 
587 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
571 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.21 
 
 
571 aa  294  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.21 
 
 
571 aa  294  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
571 aa  294  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
571 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  38.03 
 
 
642 aa  294  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.21 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
571 aa  294  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.9 
 
 
586 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  34.64 
 
 
584 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.66 
 
 
603 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.49 
 
 
604 aa  293  8e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.64 
 
 
598 aa  293  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  32.09 
 
 
592 aa  293  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 
583 aa  292  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.86 
 
 
571 aa  292  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.62 
 
 
578 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.62 
 
 
578 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.15 
 
 
586 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  36.86 
 
 
572 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.64 
 
 
598 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
572 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.82 
 
 
589 aa  290  6e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.93 
 
 
580 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.05 
 
 
597 aa  290  7e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.05 
 
 
597 aa  289  7e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.46 
 
 
578 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.51 
 
 
586 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  33.15 
 
 
591 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.35 
 
 
600 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.85 
 
 
584 aa  289  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.58 
 
 
601 aa  289  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
650 aa  288  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.09 
 
 
586 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.73 
 
 
556 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  37.58 
 
 
610 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.52 
 
 
617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  33.53 
 
 
577 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.31 
 
 
595 aa  287  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  33.79 
 
 
586 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.42 
 
 
591 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.11 
 
 
572 aa  286  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.17 
 
 
586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.03 
 
 
588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.72 
 
 
573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  33.6 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.6 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.47 
 
 
584 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  34.05 
 
 
586 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.08 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.47 
 
 
589 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.79 
 
 
586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
658 aa  283  6.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33.66 
 
 
586 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  34.05 
 
 
601 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  33.72 
 
 
586 aa  283  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  32.08 
 
 
578 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  32.53 
 
 
583 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>