More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2272 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3549  ABC transporter related  88.42 
 
 		 614 aa  1095    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2272  ABC transporter related  100 
 
 		 613 aa  1232    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3581  ABC transporter related  54.61 
 
 		 599 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.689947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2748  ABC transporter related  53.77 
 
 		 595 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0219  ABC transporter related  52.28 
 
 		 582 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.523639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  33.68 
 
 		 581 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  35.19 
 
 		 606 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.74 
 
 		 556 aa  330  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.2 
 
 		 601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  33.8 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  35.46 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  38.43 
 
 		 641 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  31.91 
 
 		 588 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 620 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  34.11 
 
 		 589 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 575 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  36.69 
 
 		 642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.92 
 
 		 584 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.7 
 
 		 608 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  36.8 
 
 		 572 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  36.78 
 
 		 572 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  32.43 
 
 		 582 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  34.03 
 
 		 614 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  33.82 
 
 		 580 aa  303  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.32 
 
 		 610 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  39.28 
 
 		 582 aa  300  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.46 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  33.49 
 
 		 597 aa  299  8e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.49 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.09 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.5 
 
 		 589 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  35.64 
 
 		 603 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  34.64 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.95 
 
 		 587 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  32.04 
 
 		 594 aa  293  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  37.6 
 
 		 567 aa  293  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  34.07 
 
 		 591 aa  293  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  36.2 
 
 		 589 aa  293  9e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0387  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 		 634 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.112413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.6 
 
 		 584 aa  292  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.6 
 
 		 567 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  35.83 
 
 		 572 aa  291  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  31.67 
 
 		 585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.58 
 
 		 597 aa  290  6e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.2 
 
 		 579 aa  289  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  32.19 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.09 
 
 		 607 aa  289  9e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  29.21 
 
 		 587 aa  289  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.83 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.76 
 
 		 609 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  33.2 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  32.97 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  33.99 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  35.07 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.05 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  33.45 
 
 		 622 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  34.35 
 
 		 582 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  34.13 
 
 		 595 aa  286  9e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3366  ABC transporter related  32.69 
 
 		 583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000372221  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  37.72 
 
 		 582 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  31.82 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.81 
 
 		 583 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 613 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  35.25 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  34.68 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  33.72 
 
 		 592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  35.25 
 
 		 602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  31.72 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1773  ABC transporter related  33.27 
 
 		 581 aa  284  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000430308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.4 
 
 		 596 aa  284  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 569 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.18 
 
 		 594 aa  283  8.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  30.83 
 
 		 636 aa  283  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.64 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.85 
 
 		 660 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  34 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  32.14 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  35.58 
 
 		 773 aa  282  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  32.48 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 604 aa  283  1e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.06 
 
 		 571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.85 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.98 
 
 		 764 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.29 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  32 
 
 		 593 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.85 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3467  ABC transporter ATP-binding/permease  32.34 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000139825  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3433  ABC transporter, ATP-binding and permease protein  32.34 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000702904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3741  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.34 
 
 		 583 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000316784  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  34.27 
 
 		 565 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  28.12 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 571 aa  280  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.47 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  33.05 
 
 		 584 aa  280  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.17 
 
 		 596 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.26 
 
 		 571 aa  280  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>