More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 617 aa  1208    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  52.14 
 
 		 613 aa  553  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  51.13 
 
 		 602 aa  544  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  53.37 
 
 		 608 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  47.46 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  52.24 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 609 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  49.57 
 
 		 589 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  46.95 
 
 		 726 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  49.83 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  49.83 
 
 		 638 aa  498  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  52.06 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  48.55 
 
 		 597 aa  490  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  47.36 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  47.22 
 
 		 605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.37 
 
 		 606 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 635 aa  449  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.52 
 
 		 730 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  44.07 
 
 		 608 aa  412  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  39.66 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.64 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  37.07 
 
 		 631 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  36.09 
 
 		 604 aa  257  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.03 
 
 		 575 aa  253  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  36.16 
 
 		 1522 aa  253  8.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  29.62 
 
 		 593 aa  253  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  37.9 
 
 		 1231 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  31.22 
 
 		 594 aa  253  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  36.61 
 
 		 984 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  38.51 
 
 		 650 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  38.51 
 
 		 650 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  38.18 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  28.52 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1226  ABC transporter, transmembrane region  35.11 
 
 		 595 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.56473  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 593 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 596 aa  239  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  35.37 
 
 		 633 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  30.23 
 
 		 587 aa  236  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.85 
 
 		 571 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5006  ABC transporter-related protein  35.73 
 
 		 634 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.73 
 
 		 583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.51 
 
 		 598 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1034  ABC transporter related  34.65 
 
 		 1321 aa  233  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.229722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.85 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.49 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.49 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  32.75 
 
 		 577 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.46 
 
 		 618 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  28.6 
 
 		 586 aa  232  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.49 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0519  ABC transporter related  35.98 
 
 		 589 aa  231  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00043092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3307  ABC transporter related  30.28 
 
 		 585 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233866  decreased coverage  0.00000537626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.3 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.3 
 
 		 571 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4165  ABC transporter related  36.13 
 
 		 607 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131788  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.72 
 
 		 582 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  32.17 
 
 		 616 aa  228  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.57 
 
 		 610 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  29.71 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  28.36 
 
 		 585 aa  227  5.0000000000000005e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  27.13 
 
 		 588 aa  227  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  32.38 
 
 		 1284 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  30.74 
 
 		 582 aa  226  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1962  ABC transporter related  35.63 
 
 		 589 aa  226  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.54 
 
 		 571 aa  226  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.98 
 
 		 602 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.58 
 
 		 582 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 1194 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  31.59 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.5 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  30.37 
 
 		 636 aa  225  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  35.1 
 
 		 577 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.5 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 604 aa  225  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  28.19 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.77 
 
 		 582 aa  224  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  33.5 
 
 		 577 aa  224  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  30.59 
 
 		 611 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  32.86 
 
 		 1301 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  27.26 
 
 		 596 aa  223  8e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.59 
 
 		 577 aa  223  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  31.37 
 
 		 600 aa  223  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  29.55 
 
 		 581 aa  223  9e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.5 
 
 		 582 aa  223  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  29.92 
 
 		 580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  29.81 
 
 		 583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  28.01 
 
 		 582 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 1218 aa  221  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  30.96 
 
 		 588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  32.63 
 
 		 578 aa  220  6e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.32 
 
 		 590 aa  220  6e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.09 
 
 		 597 aa  220  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.76 
 
 		 591 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>