More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1757 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  100 
 
 
514 aa  1027    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  41.1 
 
 
543 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  40.9 
 
 
543 aa  386  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  41.1 
 
 
543 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.25 
 
 
557 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  40.04 
 
 
542 aa  371  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  38.99 
 
 
546 aa  362  1e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  38.45 
 
 
544 aa  360  3e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.57 
 
 
547 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.57 
 
 
547 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.57 
 
 
547 aa  350  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  37.38 
 
 
547 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  37.38 
 
 
547 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  37.38 
 
 
547 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.38 
 
 
547 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.38 
 
 
547 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.91 
 
 
547 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.96 
 
 
547 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.96 
 
 
547 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.18 
 
 
547 aa  346  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.96 
 
 
547 aa  346  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.96 
 
 
547 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.96 
 
 
547 aa  346  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.55 
 
 
548 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.07 
 
 
550 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.25 
 
 
548 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.35 
 
 
553 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  37.47 
 
 
558 aa  319  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  33.4 
 
 
557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  32.63 
 
 
551 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  29.94 
 
 
546 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  29.54 
 
 
560 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.49 
 
 
564 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  29.57 
 
 
552 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  27.92 
 
 
553 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  31.49 
 
 
548 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  28.01 
 
 
552 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  26.81 
 
 
551 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  29.31 
 
 
564 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.61 
 
 
554 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  26.94 
 
 
550 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  28.57 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  27.49 
 
 
581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  27.26 
 
 
555 aa  200  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  28.01 
 
 
564 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  27.64 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  26.94 
 
 
558 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  27.44 
 
 
558 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  28.21 
 
 
550 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.66 
 
 
576 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  27.95 
 
 
563 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  29.74 
 
 
567 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  28.32 
 
 
552 aa  194  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  27.03 
 
 
556 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  28.08 
 
 
544 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  26.88 
 
 
579 aa  186  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  27.27 
 
 
562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  29.1 
 
 
571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  27.42 
 
 
566 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.22 
 
 
1055 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.1 
 
 
562 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  25.29 
 
 
588 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  24.95 
 
 
562 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  25.83 
 
 
581 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  25.43 
 
 
562 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  25.24 
 
 
562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.5 
 
 
541 aa  173  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  24.9 
 
 
581 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  26.7 
 
 
650 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  24.68 
 
 
607 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  28.08 
 
 
1032 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  24.68 
 
 
607 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  24.68 
 
 
607 aa  171  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  24.77 
 
 
581 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  27.39 
 
 
557 aa  169  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  29.87 
 
 
554 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  26.21 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  24.4 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  25.46 
 
 
551 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  26.21 
 
 
554 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 
555 aa  153  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.07 
 
 
557 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.2 
 
 
549 aa  140  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  24 
 
 
578 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3369  ABC transporter, ATP-binding protein and permease  24.13 
 
 
564 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  25.78 
 
 
572 aa  107  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3626  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.13 
 
 
549 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0591  ABC transporter-related protein  25.64 
 
 
566 aa  106  8e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  24.06 
 
 
577 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3407  ABC transporter ATP-binding/permease  24.13 
 
 
564 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3639  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.79 
 
 
549 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  24.15 
 
 
577 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3676  ABC transporter permease/ATP-binding protein  24.13 
 
 
549 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  23 
 
 
597 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01541  hypothetical protein  32.74 
 
 
552 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.29572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>