More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1007 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  100 
 
 
551 aa  1131    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.34 
 
 
557 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  48.71 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.1 
 
 
548 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.64 
 
 
547 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  44.25 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  44.25 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.06 
 
 
547 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.25 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.25 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.25 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.25 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  44.25 
 
 
547 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  43.38 
 
 
547 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  44.92 
 
 
548 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  43.19 
 
 
547 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  43.19 
 
 
547 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  43.19 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  43.19 
 
 
547 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  42.42 
 
 
547 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  42.91 
 
 
550 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  42.08 
 
 
553 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  41.96 
 
 
557 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.61 
 
 
543 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.92 
 
 
542 aa  387  1e-106  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.8 
 
 
543 aa  387  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.2 
 
 
543 aa  385  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  37.38 
 
 
546 aa  361  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  35.06 
 
 
544 aa  350  5e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  35.62 
 
 
546 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  33.46 
 
 
560 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  33.59 
 
 
551 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  35.46 
 
 
552 aa  296  5e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  31.51 
 
 
553 aa  296  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  36.02 
 
 
548 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.55 
 
 
514 aa  295  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.96 
 
 
550 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  33.71 
 
 
552 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
555 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  34.52 
 
 
562 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  34.08 
 
 
550 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  31.68 
 
 
549 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  31.52 
 
 
581 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  32.23 
 
 
558 aa  280  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.7 
 
 
581 aa  280  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  31.52 
 
 
581 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  32.44 
 
 
581 aa  279  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.02 
 
 
554 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  30.09 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.89 
 
 
564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  31.65 
 
 
607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  31.34 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  32.18 
 
 
563 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  31.97 
 
 
564 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
607 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
607 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.35 
 
 
562 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  34.69 
 
 
650 aa  270  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  32.23 
 
 
562 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  31.73 
 
 
588 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  32.77 
 
 
1055 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.5 
 
 
564 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  32.06 
 
 
571 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  32.23 
 
 
579 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  30.69 
 
 
597 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  33.08 
 
 
554 aa  252  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  30.68 
 
 
567 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  31.16 
 
 
551 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  33.26 
 
 
556 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  30.12 
 
 
544 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  33.05 
 
 
556 aa  243  6e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  32.36 
 
 
1032 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  33.84 
 
 
566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  31.31 
 
 
541 aa  239  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  31.47 
 
 
558 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.47 
 
 
554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  30.21 
 
 
557 aa  229  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.81 
 
 
576 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.75 
 
 
557 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 
555 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  25.93 
 
 
549 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.21 
 
 
280 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  31.44 
 
 
381 aa  95.1  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  28.14 
 
 
389 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.78 
 
 
280 aa  94  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  24.03 
 
 
1228 aa  93.6  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.43 
 
 
280 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  33.03 
 
 
273 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  33.03 
 
 
273 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.35 
 
 
300 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.43 
 
 
280 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  27.8 
 
 
280 aa  91.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  30.17 
 
 
737 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>