More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1530 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  100 
 
 
546 aa  1107    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  66.97 
 
 
544 aa  762    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.14 
 
 
543 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.14 
 
 
543 aa  488  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.2 
 
 
543 aa  487  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  45.37 
 
 
542 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.13 
 
 
557 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  40 
 
 
548 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  40 
 
 
548 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.03 
 
 
547 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.03 
 
 
547 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.03 
 
 
547 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.85 
 
 
547 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  41.82 
 
 
558 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.85 
 
 
547 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  38.85 
 
 
547 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  38.85 
 
 
547 aa  425  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.85 
 
 
547 aa  425  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.66 
 
 
547 aa  424  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.41 
 
 
547 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  38.85 
 
 
547 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.22 
 
 
547 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.41 
 
 
547 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.22 
 
 
547 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.22 
 
 
547 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.87 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  39.29 
 
 
557 aa  412  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.25 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  37.38 
 
 
551 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  38.99 
 
 
514 aa  356  6.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  32.9 
 
 
560 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  31.67 
 
 
548 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  32.34 
 
 
546 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.57 
 
 
554 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  32.64 
 
 
552 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  32.02 
 
 
558 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  32.54 
 
 
552 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  31.83 
 
 
549 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  32.22 
 
 
552 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.66 
 
 
567 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  32.46 
 
 
562 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.14 
 
 
564 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  31.41 
 
 
551 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  31.06 
 
 
550 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.13 
 
 
564 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  31.24 
 
 
550 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  31.58 
 
 
566 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  30.83 
 
 
558 aa  243  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  28.06 
 
 
555 aa  242  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  31.72 
 
 
564 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  31.36 
 
 
571 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  31.6 
 
 
1055 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  29.81 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  31.3 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  31.21 
 
 
556 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  31.04 
 
 
1032 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.52 
 
 
650 aa  230  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  29.81 
 
 
581 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  29.78 
 
 
579 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  28.55 
 
 
562 aa  226  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  28.85 
 
 
588 aa  226  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  32.05 
 
 
554 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  27.66 
 
 
607 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  27.37 
 
 
581 aa  219  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  30.21 
 
 
563 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  28.35 
 
 
557 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  30.2 
 
 
551 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  27.48 
 
 
607 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  27.48 
 
 
607 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  30.82 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  28.31 
 
 
562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  26.7 
 
 
581 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  26.9 
 
 
581 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  28.78 
 
 
562 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  31.32 
 
 
544 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  26.52 
 
 
581 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.66 
 
 
576 aa  207  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  30.43 
 
 
555 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  28.44 
 
 
597 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  31.48 
 
 
554 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.93 
 
 
557 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  25.52 
 
 
549 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  25.29 
 
 
617 aa  139  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76772  ATP-binding cassette transporter family member  26.08 
 
 
575 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.304707  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.08 
 
 
587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  26.14 
 
 
597 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  25.67 
 
 
609 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  25 
 
 
600 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2691  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.34 
 
 
573 aa  121  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0993753  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  24.02 
 
 
613 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  26.76 
 
 
599 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1830  ABC transporter related  36.4 
 
 
596 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  25.97 
 
 
611 aa  118  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.02 
 
 
582 aa  116  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>