More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3708 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 557 aa  1127    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  38.73 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  36.48 
 
 		 555 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  33.52 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  34.64 
 
 		 558 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.25 
 
 		 1055 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.89 
 
 		 554 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  34.2 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  32.39 
 
 		 551 aa  266  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.83 
 
 		 550 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  33.59 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  31.65 
 
 		 562 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  34.6 
 
 		 581 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  34.55 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  32.72 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  31.95 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  34.24 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.66 
 
 		 581 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  31.79 
 
 		 550 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  34.82 
 
 		 607 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  34.82 
 
 		 607 aa  258  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  34.82 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  34.43 
 
 		 553 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  33.52 
 
 		 549 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.07 
 
 		 562 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  36.17 
 
 		 597 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.25 
 
 		 564 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  29.14 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  34.6 
 
 		 562 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 		 562 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.73 
 
 		 562 aa  246  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  32.53 
 
 		 588 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  34.6 
 
 		 560 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  31.44 
 
 		 571 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  30.11 
 
 		 1032 aa  240  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  30.28 
 
 		 650 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.63 
 
 		 554 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.55 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  30.2 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  30 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  32.28 
 
 		 566 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  33 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  31.73 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.96 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  29.6 
 
 		 567 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.12 
 
 		 557 aa  216  7e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.8 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.1 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.87 
 
 		 553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  30.34 
 
 		 551 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  32.19 
 
 		 556 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  32.19 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.44 
 
 		 550 aa  207  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  31.75 
 
 		 557 aa  207  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  25.9 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.5 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  29.93 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.15 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.72 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  29.93 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.72 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.93 
 
 		 547 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.72 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  30.28 
 
 		 551 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.72 
 
 		 547 aa  196  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  29.55 
 
 		 557 aa  194  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.77 
 
 		 542 aa  193  6e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.73 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.45 
 
 		 543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  30.72 
 
 		 558 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.93 
 
 		 546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.45 
 
 		 543 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.66 
 
 		 543 aa  183  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.15 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.29 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0935  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 679 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  34.34 
 
 		 247 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  31.71 
 
 		 240 aa  94.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.44 
 
 		 566 aa  94  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  34 
 
 		 246 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  29.87 
 
 		 618 aa  92.8  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  32.27 
 
 		 727 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  25.96 
 
 		 611 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  31.39 
 
 		 247 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  26.43 
 
 		 574 aa  91.3  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  26.24 
 
 		 582 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.15 
 
 		 594 aa  91.3  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>