More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1247 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  100 
 
 		 611 aa  1235    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  35.35 
 
 		 604 aa  346  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 		 603 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 603 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  28.05 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.85 
 
 		 594 aa  247  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  32.02 
 
 		 623 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  30.91 
 
 		 625 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 596 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  29.26 
 
 		 613 aa  241  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  29.8 
 
 		 625 aa  240  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.34 
 
 		 618 aa  236  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  29.44 
 
 		 613 aa  233  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  34.85 
 
 		 594 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  28.86 
 
 		 614 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  35.95 
 
 		 610 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.24 
 
 		 600 aa  226  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  28.9 
 
 		 615 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  29.85 
 
 		 593 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  28.78 
 
 		 619 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  35.38 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  39.74 
 
 		 625 aa  222  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  29.22 
 
 		 611 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  41.83 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  29.44 
 
 		 606 aa  220  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.36 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  26.41 
 
 		 618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0029  ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 		 592 aa  213  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0444277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  27.11 
 
 		 618 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  28.31 
 
 		 621 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.46 
 
 		 566 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  27.11 
 
 		 618 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  28.46 
 
 		 625 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  29.16 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 624 aa  208  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  28.57 
 
 		 615 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  29.47 
 
 		 616 aa  207  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 		 626 aa  205  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  27.38 
 
 		 626 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 621 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  38.08 
 
 		 578 aa  203  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  38.08 
 
 		 578 aa  203  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2522  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 608 aa  203  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000536848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  25 
 
 		 621 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  25 
 
 		 621 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 		 423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.7 
 
 		 597 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  27.77 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  26.68 
 
 		 606 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3067  ABC transporter related  28.31 
 
 		 616 aa  198  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.05 
 
 		 605 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2121  ABC transporter related  41.87 
 
 		 592 aa  197  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0469837  normal  0.034956 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  30 
 
 		 590 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  34.08 
 
 		 619 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.9 
 
 		 611 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1201  ABC transporter related  37.94 
 
 		 617 aa  194  3e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  29.43 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.54 
 
 		 1000 aa  194  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  38.78 
 
 		 599 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  27.69 
 
 		 626 aa  194  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  29.69 
 
 		 602 aa  193  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.95 
 
 		 587 aa  192  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.37 
 
 		 1008 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  36.97 
 
 		 579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.37 
 
 		 1008 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  27.62 
 
 		 575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  28.85 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.2 
 
 		 573 aa  191  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 608 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.19 
 
 		 578 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.19 
 
 		 578 aa  190  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  27.16 
 
 		 597 aa  190  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  39.47 
 
 		 608 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  36.82 
 
 		 575 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1949  ABC transporter related  34.46 
 
 		 600 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867267  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  38.22 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  39.04 
 
 		 585 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  39.84 
 
 		 584 aa  189  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  29.41 
 
 		 590 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  27.98 
 
 		 601 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  39.06 
 
 		 628 aa  188  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.54 
 
 		 633 aa  188  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  31.64 
 
 		 586 aa  188  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  36.97 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.73 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.61 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  27.98 
 
 		 601 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  26.71 
 
 		 608 aa  187  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.7 
 
 		 581 aa  186  9e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  38.04 
 
 		 624 aa  186  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.09 
 
 		 577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 572 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1924  cyclic beta-1,2-glucan ABC transporter  33.43 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2905  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 609 aa  185  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.564374  normal  0.291067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>