More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1091 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 564 aa  1129    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  59.43 
 
 		 551 aa  637    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  59.1 
 
 		 550 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  56.69 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  56.42 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  56.6 
 
 		 549 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  56.82 
 
 		 562 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  55.12 
 
 		 550 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.13 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  51.5 
 
 		 558 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  53.66 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  53.45 
 
 		 564 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  53.64 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  51.74 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  49.72 
 
 		 564 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  48.13 
 
 		 557 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  46 
 
 		 558 aa  419  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  46.94 
 
 		 556 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  47.03 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  39.96 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  38.61 
 
 		 553 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  39.03 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  40.52 
 
 		 560 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  39.36 
 
 		 548 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  39.53 
 
 		 581 aa  332  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.46 
 
 		 562 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  34.7 
 
 		 566 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.29 
 
 		 581 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  37.29 
 
 		 607 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  37.29 
 
 		 607 aa  316  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  37.29 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  37.59 
 
 		 581 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  38.52 
 
 		 588 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 562 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  37.11 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  37.36 
 
 		 597 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  36.92 
 
 		 581 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  33.09 
 
 		 567 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  32.57 
 
 		 1055 aa  293  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.66 
 
 		 547 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  35.66 
 
 		 547 aa  292  9e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  35.66 
 
 		 547 aa  292  9e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.66 
 
 		 547 aa  292  9e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.01 
 
 		 548 aa  292  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.66 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.49 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.61 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.47 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.66 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.47 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.47 
 
 		 547 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.29 
 
 		 548 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  33.08 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 547 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.91 
 
 		 547 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.9 
 
 		 550 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  32.61 
 
 		 650 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  35.26 
 
 		 552 aa  266  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  32.5 
 
 		 551 aa  264  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  32.58 
 
 		 1032 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.05 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 555 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  31.32 
 
 		 551 aa  256  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.48 
 
 		 543 aa  250  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  32.37 
 
 		 558 aa  251  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.29 
 
 		 543 aa  250  5e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.29 
 
 		 543 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.63 
 
 		 542 aa  248  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  34.81 
 
 		 579 aa  247  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  29.73 
 
 		 576 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  33.14 
 
 		 546 aa  244  3e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.58 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  31.78 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  31.21 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.63 
 
 		 557 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.25 
 
 		 554 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.15 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  28.09 
 
 		 549 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  33.24 
 
 		 726 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  26.09 
 
 		 575 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.43 
 
 		 605 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.11 
 
 		 589 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.81 
 
 		 589 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  24.8 
 
 		 567 aa  108  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.39 
 
 		 581 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.66 
 
 		 567 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  26.69 
 
 		 592 aa  107  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  23.73 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  24.65 
 
 		 592 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>