More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3437 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  100 
 
 
556 aa  1102    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  85.71 
 
 
558 aa  923    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  96.22 
 
 
556 aa  1010    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  47.57 
 
 
552 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  47.04 
 
 
564 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  44.32 
 
 
552 aa  450  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  46.97 
 
 
554 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  44.28 
 
 
550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  44.53 
 
 
549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  44.86 
 
 
551 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  46.27 
 
 
550 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  43.77 
 
 
562 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.31 
 
 
564 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  43.65 
 
 
564 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.07 
 
 
554 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  43.07 
 
 
558 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  43.49 
 
 
563 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  46.54 
 
 
557 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  42.73 
 
 
571 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  38.98 
 
 
560 aa  327  5e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  36.13 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.98 
 
 
581 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  36.3 
 
 
553 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.59 
 
 
557 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  36.78 
 
 
607 aa  294  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  36.26 
 
 
548 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  36.6 
 
 
607 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  36.6 
 
 
607 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.5 
 
 
562 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  36.87 
 
 
581 aa  289  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  37.17 
 
 
581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  35.69 
 
 
566 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  36.69 
 
 
581 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  34.01 
 
 
567 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  36.13 
 
 
588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.08 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  35.08 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.2 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  35.92 
 
 
581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  38.29 
 
 
548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  35.08 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.08 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.9 
 
 
547 aa  274  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.08 
 
 
547 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.94 
 
 
548 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.9 
 
 
547 aa  274  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  33.96 
 
 
555 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.9 
 
 
547 aa  273  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.9 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  38.24 
 
 
597 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.33 
 
 
547 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.96 
 
 
547 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.96 
 
 
547 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.96 
 
 
547 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.33 
 
 
547 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  32.83 
 
 
557 aa  263  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.94 
 
 
553 aa  260  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.54 
 
 
543 aa  259  7e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.33 
 
 
543 aa  258  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.4 
 
 
550 aa  258  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.33 
 
 
543 aa  257  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  32.29 
 
 
1032 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  35.74 
 
 
579 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.33 
 
 
551 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  33.67 
 
 
544 aa  249  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  31.53 
 
 
551 aa  243  6e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  30.73 
 
 
552 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  35.96 
 
 
558 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.19 
 
 
542 aa  242  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.25 
 
 
546 aa  239  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  34.92 
 
 
650 aa  236  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  31.62 
 
 
1055 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  38.19 
 
 
544 aa  224  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  36.01 
 
 
555 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  29.66 
 
 
554 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.16 
 
 
576 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  30.06 
 
 
541 aa  210  7e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 
557 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.98 
 
 
514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  29.26 
 
 
549 aa  190  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  26.32 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.81 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1722  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.78 
 
 
594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.031974 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.64 
 
 
582 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.34 
 
 
605 aa  118  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.41 
 
 
727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1982  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  28.6 
 
 
594 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  27.45 
 
 
589 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  26.6 
 
 
618 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  26.75 
 
 
575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  27.5 
 
 
739 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.96 
 
 
597 aa  114  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>