More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1850 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  73.81 
 
 		 552 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  75.96 
 
 		 551 aa  862    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63.49 
 
 		 554 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  63 
 
 		 558 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  100 
 
 		 552 aa  1120    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  69.22 
 
 		 562 aa  782    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  65.09 
 
 		 550 aa  752    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  70.31 
 
 		 549 aa  805    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  68 
 
 		 550 aa  769    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  56.42 
 
 		 564 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  54.81 
 
 		 563 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  52.83 
 
 		 564 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  54.55 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  49.91 
 
 		 564 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  48.88 
 
 		 554 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  45.34 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  44.32 
 
 		 556 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  44.61 
 
 		 557 aa  420  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  43.85 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  40.07 
 
 		 548 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  37.8 
 
 		 546 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  38.73 
 
 		 555 aa  365  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.46 
 
 		 581 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  38.21 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  37.59 
 
 		 581 aa  360  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  37.97 
 
 		 560 aa  359  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  38.31 
 
 		 607 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  37.41 
 
 		 581 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  38.31 
 
 		 607 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.18 
 
 		 562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  38.06 
 
 		 581 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  36.61 
 
 		 588 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  37.71 
 
 		 553 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.81 
 
 		 562 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  37.9 
 
 		 581 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  37.99 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  33.51 
 
 		 566 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.33 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.79 
 
 		 548 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.86 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.9 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.12 
 
 		 557 aa  300  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.15 
 
 		 547 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  32.95 
 
 		 1055 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  35.46 
 
 		 551 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  34.97 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  34.97 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  34.97 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.97 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.97 
 
 		 547 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.79 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.79 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.27 
 
 		 1032 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.79 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  33.27 
 
 		 579 aa  291  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.72 
 
 		 547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.16 
 
 		 547 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.16 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.16 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.16 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  32.12 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  34.25 
 
 		 551 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.65 
 
 		 553 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.78 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  32.78 
 
 		 552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  33.52 
 
 		 544 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  30.33 
 
 		 576 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 555 aa  270  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.52 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  36.97 
 
 		 558 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.84 
 
 		 542 aa  268  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.77 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  33.76 
 
 		 650 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.52 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.31 
 
 		 557 aa  263  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.64 
 
 		 546 aa  256  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.57 
 
 		 544 aa  251  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.46 
 
 		 554 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.17 
 
 		 541 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  28.48 
 
 		 514 aa  188  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  27.54 
 
 		 549 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.38 
 
 		 605 aa  120  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  29.25 
 
 		 726 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.39 
 
 		 587 aa  117  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.35 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  22.41 
 
 		 870 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  28.09 
 
 		 739 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3393  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.17 
 
 		 605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.025265 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  24.63 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.26 
 
 		 605 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0610  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.69 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf684  ABC-type multidrug transport system  23.8 
 
 		 617 aa  108  2e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.486975  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.15 
 
 		 555 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>