More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0895 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0895  ABC transporter related  100 
 
 
534 aa  1048    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.6 
 
 
1000 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  25.26 
 
 
541 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  32.35 
 
 
559 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.77 
 
 
980 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  26.48 
 
 
930 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  27.37 
 
 
572 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0787  lipid export ABC transport protein  26.45 
 
 
572 aa  155  2e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  25.14 
 
 
577 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  28.33 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  25.32 
 
 
577 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  25.25 
 
 
1001 aa  153  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.32 
 
 
586 aa  153  8e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.71 
 
 
1003 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  27.06 
 
 
577 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.34 
 
 
1013 aa  152  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0117  ABC transporter related  24.91 
 
 
573 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00018995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  22.71 
 
 
582 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  28.73 
 
 
578 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  23.34 
 
 
625 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.06 
 
 
586 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.55 
 
 
572 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  24.91 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.32 
 
 
1024 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.48 
 
 
546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  24.73 
 
 
601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  23.67 
 
 
588 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.95 
 
 
976 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.28 
 
 
738 aa  148  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.03 
 
 
971 aa  146  7.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  21.94 
 
 
594 aa  147  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  27.08 
 
 
618 aa  146  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0115  ABC transporter related  26.61 
 
 
609 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4203  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  24.22 
 
 
650 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.089699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  23.51 
 
 
583 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  23.88 
 
 
728 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  24.51 
 
 
1012 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.76 
 
 
582 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  26.35 
 
 
706 aa  144  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  25.54 
 
 
588 aa  144  5e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1370  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  20.88 
 
 
598 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15083  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0637  ABC transporter related  25.38 
 
 
588 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.188311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1607  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  23.86 
 
 
590 aa  143  6e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.343192 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  25.2 
 
 
982 aa  144  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  25.2 
 
 
597 aa  143  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3434  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  23.25 
 
 
582 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  24.51 
 
 
638 aa  143  9e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  24.08 
 
 
728 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  25.27 
 
 
700 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  24.08 
 
 
712 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.94 
 
 
605 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  24.8 
 
 
1016 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  25.71 
 
 
720 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  26.3 
 
 
588 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  24.94 
 
 
620 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0894  ABC transporter related  26.19 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1105  ABC transporter related protein  27.92 
 
 
573 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  21.99 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.51 
 
 
1008 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.51 
 
 
1008 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  25.27 
 
 
750 aa  141  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  21.66 
 
 
571 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  25.85 
 
 
584 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  22.1 
 
 
606 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  25.64 
 
 
616 aa  140  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  26.83 
 
 
727 aa  140  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1437  ABC transporter related protein  27.87 
 
 
552 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1743  ABC transporter related  29.59 
 
 
542 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00261821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  23.84 
 
 
575 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  23.44 
 
 
1019 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  21.2 
 
 
595 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  24.77 
 
 
575 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.39 
 
 
587 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  23.25 
 
 
611 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  27.48 
 
 
568 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  27.25 
 
 
699 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0018  ABC transporter related  25.8 
 
 
573 aa  138  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  21.57 
 
 
580 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  26.65 
 
 
546 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2950  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  23.57 
 
 
589 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.183404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  22.25 
 
 
1257 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  24.57 
 
 
688 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  23.67 
 
 
575 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3379  ABC transporter transmembrane region  24.4 
 
 
646 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  21.77 
 
 
1218 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  26.47 
 
 
870 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  25.7 
 
 
695 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  25.85 
 
 
699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  26.54 
 
 
737 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  26.45 
 
 
629 aa  137  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  25.65 
 
 
584 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  23.6 
 
 
721 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  22.51 
 
 
721 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.01 
 
 
602 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  24.94 
 
 
566 aa  137  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.44 
 
 
580 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  24.89 
 
 
724 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0021  sublancin 168 processing and transport ATP-binding protein  25.79 
 
 
701 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  24.89 
 
 
724 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  20.95 
 
 
595 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>