More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4785 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  96.9 
 
 
607 aa  1131    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  93.45 
 
 
581 aa  1097    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  76.46 
 
 
597 aa  774    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  100 
 
 
581 aa  1160    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  81.05 
 
 
562 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  80.51 
 
 
562 aa  885    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  80.32 
 
 
562 aa  884    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  81.95 
 
 
562 aa  928    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  96.56 
 
 
607 aa  1127    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  95.35 
 
 
581 aa  1111    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  96.56 
 
 
607 aa  1127    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  95.7 
 
 
581 aa  1115    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  81.2 
 
 
588 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  49.08 
 
 
553 aa  488  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  46.77 
 
 
555 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  47.55 
 
 
560 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  46.83 
 
 
581 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  41.61 
 
 
546 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  38.26 
 
 
550 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  38.99 
 
 
548 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  37.86 
 
 
549 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  38.48 
 
 
550 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  38.46 
 
 
552 aa  362  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  37.46 
 
 
551 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  39.13 
 
 
564 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  37.48 
 
 
562 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  38.55 
 
 
571 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  34.89 
 
 
552 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.12 
 
 
564 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  37.77 
 
 
567 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  37.94 
 
 
563 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 
558 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  36.77 
 
 
566 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.64 
 
 
554 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 
564 aa  314  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  37.12 
 
 
554 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  37.21 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  38.56 
 
 
556 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  32.62 
 
 
551 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  34.16 
 
 
558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  38.35 
 
 
556 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  38.71 
 
 
558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.71 
 
 
1055 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.15 
 
 
1032 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.21 
 
 
547 aa  277  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.03 
 
 
548 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.12 
 
 
547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.1 
 
 
557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  32.46 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.7 
 
 
551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.12 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  33.14 
 
 
544 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.94 
 
 
547 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.94 
 
 
547 aa  273  6e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.57 
 
 
547 aa  273  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  33.57 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  33.57 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  33.57 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.57 
 
 
547 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.94 
 
 
547 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.39 
 
 
547 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.39 
 
 
547 aa  272  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.39 
 
 
547 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.99 
 
 
547 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.33 
 
 
548 aa  270  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.7 
 
 
553 aa  265  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.27 
 
 
550 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  35.69 
 
 
557 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  33.03 
 
 
650 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 
555 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  31.14 
 
 
557 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.7 
 
 
576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.18 
 
 
557 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  26.31 
 
 
542 aa  225  2e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.54 
 
 
543 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.36 
 
 
543 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  27.54 
 
 
543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.37 
 
 
546 aa  217  5.9999999999999996e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  27.49 
 
 
554 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.83 
 
 
544 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  27.72 
 
 
541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.98 
 
 
549 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  26.96 
 
 
514 aa  172  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1736  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  27.62 
 
 
608 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  27.25 
 
 
575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 
595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0083  ABC transporter related  33.57 
 
 
619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  25.08 
 
 
606 aa  111  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  27.03 
 
 
610 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  27.16 
 
 
615 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  23.86 
 
 
596 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  26.98 
 
 
605 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  28.2 
 
 
614 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  23.66 
 
 
596 aa  107  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>