More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2399 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  91.22 
 
 
547 aa  1014    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  91.22 
 
 
547 aa  1014    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  91.22 
 
 
547 aa  1015    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  67.76 
 
 
550 aa  726    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  91.41 
 
 
547 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  91.04 
 
 
547 aa  1013    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  99.82 
 
 
547 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  99.63 
 
 
547 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  69.84 
 
 
548 aa  764    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  66.85 
 
 
553 aa  727    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  91.22 
 
 
547 aa  1015    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  100 
 
 
547 aa  1114    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  88.12 
 
 
547 aa  985    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  69.65 
 
 
548 aa  757    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  100 
 
 
547 aa  1114    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  68.12 
 
 
557 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  91.22 
 
 
547 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  91.22 
 
 
547 aa  1014    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  99.82 
 
 
547 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  90.86 
 
 
547 aa  1012    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  48.9 
 
 
557 aa  547  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  53.64 
 
 
558 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  43.19 
 
 
551 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.63 
 
 
543 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.45 
 
 
543 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  39.27 
 
 
543 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  39.22 
 
 
546 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  35.66 
 
 
544 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.7 
 
 
542 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  37.96 
 
 
514 aa  347  4e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  35.28 
 
 
560 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  35.79 
 
 
546 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  35.46 
 
 
552 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  36.95 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  35.26 
 
 
549 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  34.53 
 
 
551 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  35.36 
 
 
552 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  35.51 
 
 
581 aa  293  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  32.71 
 
 
558 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.2 
 
 
564 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  33.96 
 
 
550 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
554 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.24 
 
 
564 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  34.27 
 
 
562 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  34.2 
 
 
550 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  32.74 
 
 
588 aa  282  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  32.79 
 
 
562 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  276  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  31.72 
 
 
553 aa  276  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.63 
 
 
581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.21 
 
 
562 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  33.03 
 
 
562 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.9 
 
 
567 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  33.39 
 
 
581 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  32.6 
 
 
581 aa  270  5e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 
581 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  33.96 
 
 
556 aa  268  2e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  33.39 
 
 
607 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  33.39 
 
 
607 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  33.39 
 
 
607 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  33.96 
 
 
556 aa  267  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  31.37 
 
 
552 aa  266  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  35.04 
 
 
558 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  34.7 
 
 
571 aa  263  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  33.39 
 
 
566 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  30.88 
 
 
555 aa  256  6e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  32.34 
 
 
554 aa  254  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  32.88 
 
 
579 aa  249  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  31.97 
 
 
563 aa  249  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  31.14 
 
 
597 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.58 
 
 
650 aa  248  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  30.99 
 
 
564 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  32.65 
 
 
557 aa  243  5e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  30.13 
 
 
551 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.98 
 
 
1055 aa  236  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  30.87 
 
 
544 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  28.76 
 
 
576 aa  226  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  29.93 
 
 
1032 aa  224  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  28.26 
 
 
541 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  26.92 
 
 
554 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  31.34 
 
 
555 aa  198  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.93 
 
 
557 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  24.6 
 
 
549 aa  154  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.18 
 
 
606 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.54 
 
 
605 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  24.66 
 
 
597 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0721  ABC transporter related  24.64 
 
 
621 aa  110  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.787703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.23 
 
 
625 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.6 
 
 
555 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3128  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.91 
 
 
609 aa  108  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.81 
 
 
589 aa  107  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.11 
 
 
375 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1366  ABC transporter related  26.61 
 
 
609 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00434177  normal  0.0240824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1431  ABC transporter related  26.61 
 
 
609 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0505297  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  32.57 
 
 
375 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>