More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03729 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1117    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  37.9 
 
 		 544 aa  334  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  31.97 
 
 		 650 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  31.82 
 
 		 1032 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  36.4 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  33.96 
 
 		 567 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  28.79 
 
 		 1055 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  36.62 
 
 		 551 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  34.36 
 
 		 550 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.22 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  35.37 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  34.93 
 
 		 558 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  35.86 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  35.86 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  35.86 
 
 		 607 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.74 
 
 		 554 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  35.7 
 
 		 581 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  36.58 
 
 		 581 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  36.05 
 
 		 562 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.49 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  35.66 
 
 		 564 aa  260  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  34.92 
 
 		 549 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  31.91 
 
 		 546 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  34.49 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.37 
 
 		 562 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 562 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  36.51 
 
 		 571 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 562 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  36.05 
 
 		 552 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  35.62 
 
 		 562 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  34.81 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  37.6 
 
 		 557 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.84 
 
 		 564 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  35.26 
 
 		 560 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.75 
 
 		 554 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  37.74 
 
 		 558 aa  242  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  32.46 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  34.48 
 
 		 554 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  31.86 
 
 		 566 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.16 
 
 		 557 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.7 
 
 		 548 aa  236  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  35.38 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  33.74 
 
 		 553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  36.48 
 
 		 597 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.38 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.97 
 
 		 543 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.97 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  33.89 
 
 		 548 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  36.18 
 
 		 556 aa  230  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  36.18 
 
 		 556 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  35 
 
 		 555 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.12 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  30.82 
 
 		 576 aa  225  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  35.76 
 
 		 563 aa  223  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.13 
 
 		 553 aa  217  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  29.5 
 
 		 557 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  30.02 
 
 		 541 aa  213  7e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  31.12 
 
 		 579 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.98 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.82 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.83 
 
 		 544 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.72 
 
 		 546 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  30.26 
 
 		 551 aa  204  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.82 
 
 		 542 aa  203  8e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  32.01 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  32.01 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  32.01 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.2 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  32.71 
 
 		 558 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.01 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.01 
 
 		 547 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.82 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.82 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.82 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.68 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.68 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.68 
 
 		 547 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.32 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.68 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  30.17 
 
 		 551 aa  190  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  25.67 
 
 		 549 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.55 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.71 
 
 		 641 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.98 
 
 		 639 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.67 
 
 		 605 aa  101  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.36 
 
 		 579 aa  97.8  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  33.48 
 
 		 242 aa  97.1  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01701  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  24.09 
 
 		 625 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  31.67 
 
 		 762 aa  95.1  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.47 
 
 		 606 aa  95.5  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  33.65 
 
 		 232 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.65 
 
 		 398 aa  94  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1371  ABC transporter-related protein  26.6 
 
 		 613 aa  94  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  23.06 
 
 		 596 aa  94  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>