More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2824 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  46.16 
 
 
725 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  46.79 
 
 
726 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  44.37 
 
 
723 aa  635    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  46.21 
 
 
718 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  46.21 
 
 
718 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  46.67 
 
 
718 aa  683    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  100 
 
 
762 aa  1556    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  47.58 
 
 
725 aa  687    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  48.29 
 
 
731 aa  715    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  46.16 
 
 
725 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  44.08 
 
 
718 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  46.35 
 
 
712 aa  673    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  45.11 
 
 
725 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  44.57 
 
 
738 aa  653    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  44.51 
 
 
720 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  46.79 
 
 
734 aa  696    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  44.32 
 
 
721 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  46.14 
 
 
712 aa  650    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 
707 aa  690    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  49.16 
 
 
711 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 
726 aa  667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  48.32 
 
 
733 aa  715    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  45.39 
 
 
725 aa  652    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  43.81 
 
 
776 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  46.03 
 
 
725 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  49.07 
 
 
704 aa  713    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  49.5 
 
 
704 aa  729    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  45.95 
 
 
725 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  46.23 
 
 
725 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  45.58 
 
 
725 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  44.74 
 
 
726 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  48.18 
 
 
731 aa  713    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  46.16 
 
 
725 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  45.03 
 
 
722 aa  669    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  44.13 
 
 
726 aa  650    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  46.93 
 
 
725 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  44.37 
 
 
734 aa  656    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  45.86 
 
 
723 aa  665    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  42.63 
 
 
740 aa  633  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  46.82 
 
 
721 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  44.68 
 
 
767 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  44.68 
 
 
721 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  44.68 
 
 
738 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  44.6 
 
 
727 aa  627  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  43.08 
 
 
756 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  45.19 
 
 
719 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  42.37 
 
 
737 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  44.48 
 
 
718 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  43.42 
 
 
743 aa  610  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  45.07 
 
 
718 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  45.07 
 
 
718 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  45.07 
 
 
718 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  42.33 
 
 
716 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  42.45 
 
 
920 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  41.25 
 
 
687 aa  547  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  39.46 
 
 
727 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  38.59 
 
 
730 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  41.24 
 
 
776 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  39.97 
 
 
718 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  39.92 
 
 
726 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  40.14 
 
 
719 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  40.94 
 
 
711 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.17 
 
 
694 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  38.16 
 
 
739 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  39.07 
 
 
713 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  36.6 
 
 
719 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  36.9 
 
 
718 aa  458  1e-127  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  35.9 
 
 
779 aa  459  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.35 
 
 
723 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  33.79 
 
 
733 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  36.32 
 
 
722 aa  452  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  35.64 
 
 
712 aa  451  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  35.11 
 
 
712 aa  450  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  33.86 
 
 
720 aa  445  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  37.74 
 
 
706 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  34.72 
 
 
742 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  35.49 
 
 
726 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  35.65 
 
 
726 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  33.24 
 
 
730 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  35.43 
 
 
726 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  35.33 
 
 
726 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 
739 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  37.45 
 
 
730 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  36.15 
 
 
729 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  33.24 
 
 
765 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  33.49 
 
 
722 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  33.33 
 
 
722 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 
722 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  33.52 
 
 
701 aa  376  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  32.15 
 
 
722 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  32.79 
 
 
700 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  31.95 
 
 
871 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  32.07 
 
 
763 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.07 
 
 
763 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  30.82 
 
 
705 aa  343  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  35.27 
 
 
867 aa  342  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.7 
 
 
724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.7 
 
 
724 aa  341  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.5 
 
 
731 aa  340  5.9999999999999996e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  32.93 
 
 
714 aa  327  5e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>