More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4601 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  56.94 
 
 		 722 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  48.58 
 
 		 726 aa  671    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  48.58 
 
 		 726 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 730 aa  1449    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  50.29 
 
 		 720 aa  690    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  48.72 
 
 		 726 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  57.08 
 
 		 722 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  56.78 
 
 		 722 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  56.94 
 
 		 722 aa  726    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  56.24 
 
 		 729 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  48.72 
 
 		 726 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  51.65 
 
 		 765 aa  687    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  46.33 
 
 		 730 aa  623  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  45.4 
 
 		 712 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  44.98 
 
 		 712 aa  590  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  44.11 
 
 		 742 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  43 
 
 		 739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  38.43 
 
 		 719 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.24 
 
 		 713 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.62 
 
 		 704 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  33.24 
 
 		 762 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  34.89 
 
 		 704 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.98 
 
 		 723 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  40.24 
 
 		 733 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  40.24 
 
 		 731 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  33.43 
 
 		 738 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  35.85 
 
 		 737 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  38.45 
 
 		 725 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  35.4 
 
 		 718 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  34.53 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  35.08 
 
 		 920 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  36.35 
 
 		 776 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  32.87 
 
 		 712 aa  395  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  34.51 
 
 		 730 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  32.52 
 
 		 718 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 		 726 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  33.81 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  32.47 
 
 		 712 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  35.17 
 
 		 756 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 		 726 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  35.63 
 
 		 725 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  35.63 
 
 		 725 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  32.57 
 
 		 725 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  34.98 
 
 		 722 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  34.09 
 
 		 726 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  35.35 
 
 		 725 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 		 707 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  35.34 
 
 		 726 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  34.78 
 
 		 725 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  35.17 
 
 		 718 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  40.62 
 
 		 867 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.25 
 
 		 718 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  34.63 
 
 		 725 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  34.63 
 
 		 725 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  31.78 
 
 		 718 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  34.63 
 
 		 725 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  37.06 
 
 		 731 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  35.02 
 
 		 734 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  38.74 
 
 		 721 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  35.02 
 
 		 743 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  35.06 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  38.33 
 
 		 779 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  38.08 
 
 		 871 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  35.98 
 
 		 776 aa  376  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  35 
 
 		 740 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  34.42 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  34.81 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  38.74 
 
 		 722 aa  366  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.81 
 
 		 711 aa  364  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  36.16 
 
 		 721 aa  363  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  36.21 
 
 		 723 aa  360  6e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.22 
 
 		 734 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  38.58 
 
 		 719 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  33.59 
 
 		 767 aa  351  3e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  33.38 
 
 		 738 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  30.71 
 
 		 687 aa  347  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  36.7 
 
 		 711 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  31.84 
 
 		 718 aa  343  7e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  37.04 
 
 		 751 aa  342  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  34.4 
 
 		 721 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  36.52 
 
 		 739 aa  340  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  34.46 
 
 		 718 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  34.46 
 
 		 718 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  34.75 
 
 		 719 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  33.91 
 
 		 716 aa  333  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  34.3 
 
 		 718 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  34.3 
 
 		 718 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  37.54 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.89 
 
 		 694 aa  324  3e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  32.84 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  31.06 
 
 		 727 aa  308  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  34.33 
 
 		 706 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.51 
 
 		 763 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.51 
 
 		 763 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.99 
 
 		 700 aa  295  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  31.42 
 
 		 726 aa  294  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.24 
 
 		 739 aa  293  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.62 
 
 		 722 aa  291  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.52 
 
 		 741 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  30.46 
 
 		 724 aa  279  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>