More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05072 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 739 aa  1452    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  77.78 
 
 		 742 aa  1077    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  41.89 
 
 		 712 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  43.1 
 
 		 720 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  41.94 
 
 		 712 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  43 
 
 		 730 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  38.87 
 
 		 726 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  38.37 
 
 		 726 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  38.37 
 
 		 726 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  38.6 
 
 		 726 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  39.7 
 
 		 730 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  41.59 
 
 		 729 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  42.57 
 
 		 722 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  42.43 
 
 		 722 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  42.57 
 
 		 722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  42.14 
 
 		 722 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  38.76 
 
 		 765 aa  455  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  39.97 
 
 		 719 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  35.18 
 
 		 737 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  35.58 
 
 		 756 aa  416  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  35.49 
 
 		 776 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.11 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  33.13 
 
 		 762 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.89 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  34.16 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  33.38 
 
 		 738 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  36.82 
 
 		 776 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  38.4 
 
 		 733 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  38.4 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  35.98 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  37.82 
 
 		 920 aa  395  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  34.1 
 
 		 718 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  33.79 
 
 		 718 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  39.03 
 
 		 871 aa  395  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.68 
 
 		 723 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.14 
 
 		 704 aa  390  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  33.29 
 
 		 743 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  34.5 
 
 		 718 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  36.42 
 
 		 740 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  35.74 
 
 		 867 aa  375  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  35.41 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  31.91 
 
 		 704 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  34.95 
 
 		 718 aa  366  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  37.33 
 
 		 723 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  30.7 
 
 		 712 aa  365  2e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  34.29 
 
 		 720 aa  363  8e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  32.82 
 
 		 730 aa  363  8e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  33.03 
 
 		 767 aa  360  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  30.8 
 
 		 712 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  33.94 
 
 		 725 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  37.54 
 
 		 716 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.89 
 
 		 738 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  37.72 
 
 		 719 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  38.93 
 
 		 711 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  35.14 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  35.14 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  35.14 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  34.1 
 
 		 718 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.56 
 
 		 711 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  35.14 
 
 		 725 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  32.87 
 
 		 723 aa  350  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 		 707 aa  347  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  32.48 
 
 		 725 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  34.89 
 
 		 725 aa  344  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  36.25 
 
 		 721 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  34.88 
 
 		 725 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  34.88 
 
 		 725 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  32.93 
 
 		 721 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  34.75 
 
 		 726 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  36.76 
 
 		 721 aa  341  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  37.21 
 
 		 779 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  35.34 
 
 		 739 aa  340  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  37.68 
 
 		 733 aa  339  9e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  35.4 
 
 		 725 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  34.09 
 
 		 718 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  34.09 
 
 		 718 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  34.09 
 
 		 718 aa  336  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  34.26 
 
 		 726 aa  334  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  33.61 
 
 		 751 aa  334  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  32.65 
 
 		 726 aa  333  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  33.38 
 
 		 718 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  32.58 
 
 		 687 aa  332  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  34.25 
 
 		 719 aa  330  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  31.19 
 
 		 734 aa  330  7e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  32.81 
 
 		 714 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  32.1 
 
 		 726 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  34.02 
 
 		 725 aa  327  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  37.34 
 
 		 722 aa  324  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  31.08 
 
 		 727 aa  316  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  32.31 
 
 		 727 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  34.75 
 
 		 726 aa  312  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  32.49 
 
 		 706 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  30.52 
 
 		 701 aa  296  1e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  35.02 
 
 		 722 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.64 
 
 		 722 aa  289  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.47 
 
 		 694 aa  272  1e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.16 
 
 		 731 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  29.25 
 
 		 728 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4325  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.19 
 
 		 767 aa  268  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.34 
 
 		 763 aa  267  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>