More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4382 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  92.52 
 
 		 722 aa  1264    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  52.46 
 
 		 726 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  92.8 
 
 		 722 aa  1266    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  93.21 
 
 		 722 aa  1275    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  52.31 
 
 		 726 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  52.17 
 
 		 726 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  56.78 
 
 		 730 aa  773    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  52.31 
 
 		 726 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  57.18 
 
 		 729 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  51.35 
 
 		 730 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  53.92 
 
 		 720 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  51.34 
 
 		 765 aa  694    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 722 aa  1429    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  44.88 
 
 		 712 aa  606  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  45.31 
 
 		 712 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  41.9 
 
 		 742 aa  502  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  43.69 
 
 		 713 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  40.83 
 
 		 719 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.28 
 
 		 723 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  36.59 
 
 		 722 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  33.54 
 
 		 762 aa  415  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  36.93 
 
 		 737 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  35.83 
 
 		 718 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  33.96 
 
 		 718 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  37.8 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  33.57 
 
 		 704 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  37.8 
 
 		 733 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  36.83 
 
 		 718 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.29 
 
 		 704 aa  405  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  36.39 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  36.25 
 
 		 738 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  37.61 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  37.78 
 
 		 720 aa  402  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  35.73 
 
 		 756 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  33.89 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  37.52 
 
 		 723 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  39.25 
 
 		 871 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  39.04 
 
 		 776 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  32.69 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  39.61 
 
 		 776 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  36.56 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  38.93 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  32.61 
 
 		 707 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  34.25 
 
 		 730 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  38.92 
 
 		 779 aa  382  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  35.89 
 
 		 920 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  37.44 
 
 		 725 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  35.76 
 
 		 718 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  37.28 
 
 		 719 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  35.94 
 
 		 743 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  31.11 
 
 		 734 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  32.67 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  34.55 
 
 		 723 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.83 
 
 		 711 aa  372  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  35.97 
 
 		 721 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  37.5 
 
 		 721 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  33.48 
 
 		 687 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  37 
 
 		 725 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  37 
 
 		 725 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  34.95 
 
 		 725 aa  369  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  38.95 
 
 		 739 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  32.91 
 
 		 725 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  36.82 
 
 		 726 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  37.79 
 
 		 722 aa  363  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  37.11 
 
 		 716 aa  362  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  34.95 
 
 		 721 aa  361  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  34.34 
 
 		 726 aa  360  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 		 726 aa  360  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  33.13 
 
 		 725 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  33.13 
 
 		 725 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  33.84 
 
 		 725 aa  356  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  32.98 
 
 		 725 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  33.33 
 
 		 718 aa  355  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  34.34 
 
 		 725 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  32.83 
 
 		 726 aa  353  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  36.57 
 
 		 711 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  37.17 
 
 		 867 aa  347  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  33.13 
 
 		 738 aa  346  7e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  34.34 
 
 		 727 aa  346  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  33.13 
 
 		 767 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  34.34 
 
 		 718 aa  343  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  34.49 
 
 		 718 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  34.64 
 
 		 718 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  34.64 
 
 		 718 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  34.42 
 
 		 719 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.45 
 
 		 694 aa  333  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  35.88 
 
 		 751 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  33.69 
 
 		 706 aa  320  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  36.48 
 
 		 733 aa  319  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  33.68 
 
 		 731 aa  319  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  31.32 
 
 		 727 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.52 
 
 		 722 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  31.08 
 
 		 739 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.83 
 
 		 700 aa  300  6e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  32.39 
 
 		 726 aa  298  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  33.63 
 
 		 731 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.86 
 
 		 741 aa  296  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 724 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 724 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>