More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0804 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  100 
 
 
722 aa  1432    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  50.64 
 
 
730 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  51.42 
 
 
726 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  51.42 
 
 
726 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  56.76 
 
 
730 aa  770    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  99.72 
 
 
722 aa  1429    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  51.42 
 
 
726 aa  698    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  97.51 
 
 
722 aa  1315    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  54.36 
 
 
720 aa  736    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  57.44 
 
 
729 aa  736    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  92.52 
 
 
722 aa  1253    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  51.34 
 
 
765 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  51.42 
 
 
726 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  45.45 
 
 
712 aa  605  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  45.65 
 
 
712 aa  600  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  42.08 
 
 
742 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  42.04 
 
 
739 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  43.34 
 
 
713 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  39.58 
 
 
719 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  42.06 
 
 
723 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  33.49 
 
 
762 aa  412  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  36.09 
 
 
718 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  36.09 
 
 
718 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  36.4 
 
 
722 aa  411  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  33.24 
 
 
704 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  37.27 
 
 
737 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  33.05 
 
 
704 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.74 
 
 
731 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  33.89 
 
 
712 aa  399  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  37.44 
 
 
731 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  37.44 
 
 
733 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  36.07 
 
 
740 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  36.38 
 
 
718 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  37.18 
 
 
723 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  34.05 
 
 
738 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  33.13 
 
 
712 aa  389  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  38.42 
 
 
776 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  35.34 
 
 
756 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  38.6 
 
 
871 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  35.33 
 
 
776 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  36.16 
 
 
720 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  36.02 
 
 
718 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  36.39 
 
 
718 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  32.32 
 
 
725 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  33.95 
 
 
723 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 
734 aa  379  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  33.29 
 
 
730 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.28 
 
 
711 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  38.13 
 
 
779 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  30.98 
 
 
707 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  34.96 
 
 
920 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  33.48 
 
 
725 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  33.48 
 
 
725 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  33.9 
 
 
725 aa  376  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  33.33 
 
 
725 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  33.48 
 
 
726 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.68 
 
 
725 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  36.62 
 
 
719 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  35.33 
 
 
743 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  33.79 
 
 
687 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  34.37 
 
 
726 aa  369  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  31.76 
 
 
726 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 
726 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.5 
 
 
734 aa  364  3e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  37.96 
 
 
722 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  32.34 
 
 
725 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  32.34 
 
 
725 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  33 
 
 
725 aa  363  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  33.48 
 
 
725 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  32.2 
 
 
725 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  38.07 
 
 
721 aa  362  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  34.8 
 
 
721 aa  361  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  36.21 
 
 
721 aa  355  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  35.37 
 
 
716 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  36.5 
 
 
718 aa  351  3e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  34.74 
 
 
727 aa  349  9e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  37.98 
 
 
739 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  37.52 
 
 
867 aa  348  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  36.27 
 
 
711 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.73 
 
 
738 aa  343  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  32.73 
 
 
767 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  34.04 
 
 
718 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  34.34 
 
 
718 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  34.19 
 
 
718 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  34.19 
 
 
718 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  34.19 
 
 
719 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  35.35 
 
 
751 aa  325  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  36.48 
 
 
733 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.71 
 
 
694 aa  325  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  33.69 
 
 
706 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
727 aa  312  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.79 
 
 
722 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  32.47 
 
 
731 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  33.94 
 
 
714 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  32.07 
 
 
726 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  33.68 
 
 
722 aa  296  7e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28 
 
 
700 aa  296  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.83 
 
 
724 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.83 
 
 
724 aa  295  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.1 
 
 
739 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>