More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1758 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 779 aa  1547    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  48.12 
 
 		 776 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  42.6 
 
 		 731 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  42.74 
 
 		 733 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  38.94 
 
 		 704 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.59 
 
 		 731 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  37.85 
 
 		 704 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  37.01 
 
 		 776 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  35.42 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  35.9 
 
 		 762 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  35.64 
 
 		 712 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  39.47 
 
 		 725 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  38.96 
 
 		 734 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  35.37 
 
 		 738 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  38.22 
 
 		 756 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  37.69 
 
 		 707 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  36.39 
 
 		 712 aa  478  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  38.42 
 
 		 737 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  40.11 
 
 		 721 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  38.95 
 
 		 740 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  37.48 
 
 		 730 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  38.66 
 
 		 718 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  37.77 
 
 		 743 aa  472  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 726 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  38.38 
 
 		 722 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  38.85 
 
 		 723 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  37.35 
 
 		 920 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  36.38 
 
 		 718 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  35.3 
 
 		 734 aa  462  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  37.2 
 
 		 723 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  37.76 
 
 		 726 aa  459  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  40.11 
 
 		 719 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.1 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  37.27 
 
 		 720 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  40.36 
 
 		 721 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  35.52 
 
 		 725 aa  452  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  37.07 
 
 		 726 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  36.38 
 
 		 738 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  34.34 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  34.34 
 
 		 718 aa  446  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  38.46 
 
 		 721 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  38.98 
 
 		 716 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  36.64 
 
 		 767 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  36.78 
 
 		 725 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  36.92 
 
 		 725 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  36.78 
 
 		 725 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  37.48 
 
 		 725 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  37.34 
 
 		 725 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  36.78 
 
 		 725 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  36.31 
 
 		 725 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  38.46 
 
 		 718 aa  436  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  37.48 
 
 		 725 aa  436  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  36.74 
 
 		 726 aa  432  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  36.5 
 
 		 725 aa  427  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  35.61 
 
 		 727 aa  429  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  40.42 
 
 		 711 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  38.04 
 
 		 712 aa  425  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  36.06 
 
 		 687 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  38.3 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 		 712 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  41.03 
 
 		 722 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  38.3 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  38.16 
 
 		 718 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  37.85 
 
 		 733 aa  419  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  37.48 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  39.14 
 
 		 719 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.55 
 
 		 694 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  37.17 
 
 		 719 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  34.76 
 
 		 727 aa  392  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 		 730 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  37.24 
 
 		 720 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.66 
 
 		 723 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.74 
 
 		 713 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  33.73 
 
 		 739 aa  376  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  35.89 
 
 		 729 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  37.55 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  39.15 
 
 		 742 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  34.27 
 
 		 871 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  37.61 
 
 		 706 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  36.41 
 
 		 763 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.41 
 
 		 763 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  36.36 
 
 		 726 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  36.36 
 
 		 726 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  36.36 
 
 		 726 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  36.36 
 
 		 726 aa  357  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  39.27 
 
 		 722 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  38.73 
 
 		 722 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  38.8 
 
 		 722 aa  353  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  38.57 
 
 		 722 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  33.51 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  35.3 
 
 		 867 aa  343  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  36.75 
 
 		 765 aa  339  9e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  35.78 
 
 		 730 aa  330  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  35.34 
 
 		 751 aa  320  5e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  30.34 
 
 		 739 aa  320  7.999999999999999e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  33.58 
 
 		 714 aa  320  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 		 722 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.77 
 
 		 741 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  31.28 
 
 		 731 aa  304  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.57 
 
 		 750 aa  301  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>