More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2907 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  51.81 
 
 
722 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  48.72 
 
 
730 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  72.71 
 
 
730 aa  1055    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  99.04 
 
 
726 aa  1458    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  100 
 
 
726 aa  1471    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  47.97 
 
 
720 aa  666    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  99.45 
 
 
726 aa  1463    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  52.31 
 
 
722 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  99.17 
 
 
726 aa  1462    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  51.66 
 
 
722 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  51.95 
 
 
722 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  46.64 
 
 
765 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  47.68 
 
 
729 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  41.97 
 
 
712 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  42.63 
 
 
712 aa  557  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  40.14 
 
 
742 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 
739 aa  475  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  40.5 
 
 
719 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  41.77 
 
 
713 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  41.43 
 
 
723 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  35.49 
 
 
762 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  32.43 
 
 
704 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  34.62 
 
 
734 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  31.73 
 
 
704 aa  399  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  35.32 
 
 
871 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  34.55 
 
 
725 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  34.33 
 
 
776 aa  389  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  34.65 
 
 
738 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  36.88 
 
 
867 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  33.04 
 
 
718 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.9 
 
 
718 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  34.89 
 
 
733 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  36.14 
 
 
723 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  32.82 
 
 
756 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  34.37 
 
 
737 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  34.31 
 
 
725 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  34.31 
 
 
725 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  34.4 
 
 
776 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  34.59 
 
 
731 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  34.46 
 
 
722 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  33.77 
 
 
726 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  33.92 
 
 
725 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  33.77 
 
 
726 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 
725 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  33.33 
 
 
725 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  33.14 
 
 
723 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  33.33 
 
 
725 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 
725 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  32.7 
 
 
725 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  33.63 
 
 
725 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  32.94 
 
 
920 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  30.09 
 
 
707 aa  365  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  32.94 
 
 
726 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  33.43 
 
 
718 aa  363  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  34.63 
 
 
718 aa  362  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  33.33 
 
 
712 aa  362  1e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  35.94 
 
 
718 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  31.85 
 
 
726 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  33.7 
 
 
712 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  36.01 
 
 
740 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  32.94 
 
 
727 aa  357  5e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.34 
 
 
711 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  36.73 
 
 
751 aa  354  4e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.61 
 
 
725 aa  353  5e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.92 
 
 
731 aa  353  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  34.28 
 
 
721 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  31.46 
 
 
730 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  32.54 
 
 
743 aa  346  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  35.92 
 
 
720 aa  344  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  31.21 
 
 
767 aa  342  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  34.07 
 
 
721 aa  342  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  33.86 
 
 
716 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  31.07 
 
 
738 aa  340  7e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  35.27 
 
 
779 aa  339  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  36.02 
 
 
718 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  35.75 
 
 
718 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  35.75 
 
 
718 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  35.75 
 
 
718 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  30.68 
 
 
718 aa  331  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  35.24 
 
 
721 aa  330  6e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.27 
 
 
734 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  35.47 
 
 
719 aa  321  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  36.56 
 
 
739 aa  320  7.999999999999999e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  35.93 
 
 
711 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  33.52 
 
 
687 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  35.28 
 
 
722 aa  313  4.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  34.99 
 
 
714 aa  313  9e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  34.98 
 
 
719 aa  312  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.89 
 
 
694 aa  297  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.49 
 
 
722 aa  296  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  31.06 
 
 
706 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  33.95 
 
 
733 aa  293  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  29.69 
 
 
727 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  32.24 
 
 
722 aa  291  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.6 
 
 
763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
763 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  29.07 
 
 
701 aa  282  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  32.74 
 
 
726 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.22 
 
 
700 aa  271  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  28.45 
 
 
724 aa  270  5e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>