More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3062 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  69.12 
 
 		 718 aa  979    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 767 aa  1561    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  69.12 
 
 		 718 aa  982    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  67.69 
 
 		 726 aa  937    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  44.68 
 
 		 762 aa  649    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  69.12 
 
 		 718 aa  979    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  93.35 
 
 		 738 aa  1421    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  59.55 
 
 		 716 aa  821    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  47.99 
 
 		 731 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  68.36 
 
 		 721 aa  1006    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  57.24 
 
 		 719 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  48.72 
 
 		 733 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  62.76 
 
 		 727 aa  923    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  55.57 
 
 		 711 aa  760    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  69.55 
 
 		 718 aa  998    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  48.43 
 
 		 731 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  46.08 
 
 		 725 aa  631  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  42.5 
 
 		 734 aa  615  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  44.64 
 
 		 740 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  42.28 
 
 		 718 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  44.29 
 
 		 721 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  42.43 
 
 		 711 aa  605  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 		 707 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  43.71 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  44.02 
 
 		 722 aa  595  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  42.75 
 
 		 712 aa  594  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  42.82 
 
 		 734 aa  592  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  42.57 
 
 		 704 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  42.17 
 
 		 723 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  41.03 
 
 		 718 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  42.51 
 
 		 712 aa  588  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  43.19 
 
 		 718 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  43.12 
 
 		 718 aa  584  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  42.03 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  44.68 
 
 		 721 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  41.68 
 
 		 776 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  41.92 
 
 		 743 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  42.29 
 
 		 756 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  40.49 
 
 		 720 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  40.84 
 
 		 737 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  43.56 
 
 		 719 aa  559  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  39.63 
 
 		 726 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  40.86 
 
 		 723 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  40.63 
 
 		 726 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  40.77 
 
 		 725 aa  555  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  39.37 
 
 		 725 aa  555  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  39.91 
 
 		 725 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  39.91 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  40.14 
 
 		 726 aa  551  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  40.34 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  39.91 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  39.91 
 
 		 725 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  39.71 
 
 		 726 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  40.51 
 
 		 725 aa  548  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  40.23 
 
 		 725 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  40 
 
 		 725 aa  548  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  39.08 
 
 		 687 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  39.14 
 
 		 727 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  40.46 
 
 		 920 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  39.97 
 
 		 776 aa  505  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  36.92 
 
 		 730 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  37.2 
 
 		 718 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  37.3 
 
 		 718 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.38 
 
 		 694 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  41.44 
 
 		 739 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  34.69 
 
 		 719 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  37.09 
 
 		 733 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  35.5 
 
 		 722 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.55 
 
 		 713 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  36.64 
 
 		 779 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  35.98 
 
 		 706 aa  415  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.27 
 
 		 723 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  36.3 
 
 		 712 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  34.78 
 
 		 701 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  36.12 
 
 		 712 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  33.18 
 
 		 742 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  32.59 
 
 		 739 aa  365  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  32.69 
 
 		 720 aa  361  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.39 
 
 		 763 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 763 aa  360  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  32.72 
 
 		 871 aa  356  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.21 
 
 		 726 aa  355  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.21 
 
 		 726 aa  355  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  33.59 
 
 		 730 aa  354  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  31.07 
 
 		 726 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  31.07 
 
 		 726 aa  352  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  34.6 
 
 		 714 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  34.42 
 
 		 729 aa  342  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  34.04 
 
 		 867 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  31.87 
 
 		 730 aa  336  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.94 
 
 		 722 aa  334  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  33.28 
 
 		 722 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  32.98 
 
 		 722 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.73 
 
 		 722 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  33.8 
 
 		 751 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  33.38 
 
 		 722 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  33.58 
 
 		 765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  33.7 
 
 		 724 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  32.53 
 
 		 722 aa  321  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  29.7 
 
 		 700 aa  319  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>