More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0786 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.73 
 
 
722 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4325  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  52.97 
 
 
767 aa  756    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  100 
 
 
722 aa  1457    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2844  ABC transporter ATP-binding protein  54.66 
 
 
753 aa  748    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  36.77 
 
 
751 aa  382  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  35.2 
 
 
867 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  34.3 
 
 
714 aa  366  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  36.56 
 
 
719 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  32.78 
 
 
737 aa  336  9e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  33.77 
 
 
721 aa  334  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  35.08 
 
 
738 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  32.22 
 
 
776 aa  329  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  32.55 
 
 
704 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  31.8 
 
 
704 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  32.77 
 
 
730 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  32.21 
 
 
734 aa  324  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  35.65 
 
 
733 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  33.21 
 
 
718 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  34.91 
 
 
713 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  32.91 
 
 
743 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  30.51 
 
 
776 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  32.97 
 
 
718 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  31.66 
 
 
920 aa  317  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.47 
 
 
718 aa  316  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  32.29 
 
 
718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  33.39 
 
 
722 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  32.63 
 
 
716 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  33.09 
 
 
740 aa  313  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  31.59 
 
 
718 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  33.03 
 
 
723 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  30.72 
 
 
707 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.36 
 
 
738 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.49 
 
 
723 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  32.77 
 
 
718 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  32.77 
 
 
718 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.97 
 
 
711 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  32.99 
 
 
718 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  32.53 
 
 
767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  32.93 
 
 
720 aa  305  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  30.44 
 
 
762 aa  302  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  33.16 
 
 
718 aa  300  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  32.18 
 
 
718 aa  299  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.42 
 
 
731 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  31.39 
 
 
731 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  30.91 
 
 
756 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  31.39 
 
 
733 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  32.54 
 
 
725 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  34.87 
 
 
742 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  31.14 
 
 
721 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  31.65 
 
 
719 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  30.57 
 
 
712 aa  292  1e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  32.24 
 
 
726 aa  291  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.09 
 
 
726 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  31.11 
 
 
726 aa  289  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  31.84 
 
 
726 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  31.11 
 
 
726 aa  287  5e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  32.09 
 
 
726 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  31.93 
 
 
726 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  32.2 
 
 
719 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  33.69 
 
 
765 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  31.42 
 
 
723 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.26 
 
 
734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  34.84 
 
 
739 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  30.74 
 
 
725 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  30.74 
 
 
725 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  29.85 
 
 
725 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  30.74 
 
 
725 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  31.3 
 
 
726 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  30.74 
 
 
725 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  30.93 
 
 
725 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  30.93 
 
 
725 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  30.56 
 
 
725 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  30.19 
 
 
725 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  30.57 
 
 
725 aa  280  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  32.44 
 
 
729 aa  280  7e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  30.98 
 
 
711 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  29.39 
 
 
712 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  33.64 
 
 
871 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  28.72 
 
 
712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  30.84 
 
 
706 aa  274  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.7 
 
 
694 aa  275  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  31.03 
 
 
722 aa  274  4.0000000000000004e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  30.13 
 
 
712 aa  274  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  32.53 
 
 
730 aa  272  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  33.14 
 
 
730 aa  272  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  31.59 
 
 
721 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  30.74 
 
 
727 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  31.55 
 
 
720 aa  270  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  32.03 
 
 
739 aa  267  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  33.45 
 
 
779 aa  266  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  33.68 
 
 
722 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  33.62 
 
 
722 aa  260  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  33.8 
 
 
722 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.91 
 
 
763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  29.91 
 
 
763 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  29.83 
 
 
726 aa  253  7e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  29.54 
 
 
701 aa  253  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  32.53 
 
 
722 aa  250  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  28.25 
 
 
727 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  28.77 
 
 
687 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>