More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2196 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  100 
 
 		 763 aa  1533    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 763 aa  1533    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  39.96 
 
 		 731 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  36.35 
 
 		 712 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  38.16 
 
 		 776 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  38.07 
 
 		 734 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  35.42 
 
 		 712 aa  394  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  37.46 
 
 		 737 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  35.19 
 
 		 718 aa  392  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  31.68 
 
 		 738 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  36.06 
 
 		 756 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  35.07 
 
 		 704 aa  375  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  36.17 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  36.4 
 
 		 776 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  37.06 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  35.81 
 
 		 739 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  37.76 
 
 		 731 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  37.41 
 
 		 733 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  37.52 
 
 		 721 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  34.47 
 
 		 704 aa  365  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  35.92 
 
 		 740 aa  363  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  30.93 
 
 		 920 aa  360  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  32.58 
 
 		 725 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  34.27 
 
 		 718 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  35.82 
 
 		 718 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  33.21 
 
 		 734 aa  356  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  34.09 
 
 		 718 aa  354  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  33.39 
 
 		 725 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  34.81 
 
 		 723 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  33.39 
 
 		 726 aa  353  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.28 
 
 		 725 aa  353  7e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  33.75 
 
 		 723 aa  353  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  33.21 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  33.21 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  33.21 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  33.21 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  32.5 
 
 		 726 aa  352  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  34.43 
 
 		 743 aa  352  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  33.57 
 
 		 725 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  33.03 
 
 		 726 aa  351  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  33.21 
 
 		 725 aa  350  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  36.41 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  32.86 
 
 		 725 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  33.39 
 
 		 767 aa  347  5e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  33.69 
 
 		 738 aa  347  6e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  32.07 
 
 		 762 aa  345  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  35.53 
 
 		 721 aa  344  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  32.15 
 
 		 726 aa  344  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  33.57 
 
 		 725 aa  344  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  33.81 
 
 		 722 aa  343  5e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  33.57 
 
 		 718 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  32.97 
 
 		 721 aa  336  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  36.11 
 
 		 719 aa  336  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  35.05 
 
 		 733 aa  331  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  31.24 
 
 		 727 aa  331  4e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  34.49 
 
 		 722 aa  328  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  33.86 
 
 		 727 aa  326  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  32.62 
 
 		 707 aa  326  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  32.99 
 
 		 718 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  32.99 
 
 		 718 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  32.99 
 
 		 718 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  33.33 
 
 		 718 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  34.16 
 
 		 720 aa  324  5e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.58 
 
 		 711 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  33.44 
 
 		 716 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  32.55 
 
 		 687 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  33.75 
 
 		 726 aa  306  7e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  31.88 
 
 		 867 aa  298  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  33.87 
 
 		 711 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.61 
 
 		 722 aa  298  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  33.75 
 
 		 719 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  32.76 
 
 		 720 aa  296  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  33.51 
 
 		 730 aa  293  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  33.1 
 
 		 871 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  30.5 
 
 		 712 aa  289  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.32 
 
 		 726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  32.09 
 
 		 726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.6 
 
 		 726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  29.3 
 
 		 701 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.6 
 
 		 726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.52 
 
 		 694 aa  284  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  30.5 
 
 		 712 aa  284  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  28.38 
 
 		 714 aa  281  3e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  31.34 
 
 		 751 aa  275  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  30.78 
 
 		 719 aa  273  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  31.91 
 
 		 730 aa  273  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  31.88 
 
 		 742 aa  272  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4325  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.48 
 
 		 767 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  32.89 
 
 		 729 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  30.28 
 
 		 706 aa  270  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  31.27 
 
 		 765 aa  266  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.65 
 
 		 731 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  30.34 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  33.22 
 
 		 722 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  29.91 
 
 		 722 aa  255  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  33.63 
 
 		 722 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  29.05 
 
 		 731 aa  255  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  33.45 
 
 		 722 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  31.74 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  27.83 
 
 		 700 aa  250  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>