More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4325 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  51.08 
 
 
722 aa  722    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4325  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
767 aa  1563    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  52.97 
 
 
722 aa  781    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2844  ABC transporter ATP-binding protein  73.04 
 
 
753 aa  1058    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  32.11 
 
 
867 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  33.28 
 
 
751 aa  385  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  34.23 
 
 
714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  34.13 
 
 
737 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  32.85 
 
 
704 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  34.48 
 
 
719 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  32.13 
 
 
704 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  31.63 
 
 
738 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  32.07 
 
 
718 aa  336  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  31.91 
 
 
718 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  32.54 
 
 
730 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  30.94 
 
 
718 aa  333  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  33.82 
 
 
743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  33.52 
 
 
718 aa  328  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  35.25 
 
 
721 aa  328  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  30.77 
 
 
776 aa  327  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  31.7 
 
 
712 aa  326  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  33.15 
 
 
712 aa  324  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  32.24 
 
 
920 aa  323  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  30.16 
 
 
712 aa  322  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  32.14 
 
 
722 aa  322  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
707 aa  321  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  33.88 
 
 
740 aa  319  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  32.97 
 
 
723 aa  319  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 
734 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  33.01 
 
 
767 aa  318  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  30.51 
 
 
762 aa  318  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  31.69 
 
 
721 aa  318  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  32.75 
 
 
738 aa  318  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.93 
 
 
713 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 
726 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  31.63 
 
 
776 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  32.56 
 
 
718 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  32.87 
 
 
718 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  32.87 
 
 
718 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  30.71 
 
 
726 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  31.1 
 
 
725 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  30.95 
 
 
723 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  30.87 
 
 
725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  30.77 
 
 
725 aa  310  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  32.42 
 
 
712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  31.42 
 
 
718 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  32.15 
 
 
718 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  32.1 
 
 
725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  30.91 
 
 
756 aa  306  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.45 
 
 
725 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  29.29 
 
 
726 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  30.17 
 
 
725 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  31.55 
 
 
726 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  30.37 
 
 
733 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  29.95 
 
 
711 aa  303  7.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  29.61 
 
 
725 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  29.61 
 
 
725 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  30.37 
 
 
731 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  29.61 
 
 
725 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  29.61 
 
 
725 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  32.97 
 
 
716 aa  302  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.23 
 
 
723 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  31.92 
 
 
720 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  30.19 
 
 
718 aa  296  9e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  31.15 
 
 
729 aa  294  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  29.45 
 
 
725 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  31.14 
 
 
731 aa  288  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  33.64 
 
 
871 aa  289  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  32.86 
 
 
733 aa  287  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  29.95 
 
 
726 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  33.1 
 
 
720 aa  287  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  33.04 
 
 
779 aa  286  7e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.48 
 
 
763 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  29.48 
 
 
763 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  32.17 
 
 
727 aa  286  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  29.95 
 
 
726 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  33.39 
 
 
742 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  30.26 
 
 
726 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  30.08 
 
 
726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  32.62 
 
 
765 aa  284  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  29.21 
 
 
730 aa  283  7.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  29.91 
 
 
734 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  33.79 
 
 
730 aa  281  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  31.71 
 
 
711 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  31.53 
 
 
719 aa  279  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  31.95 
 
 
739 aa  277  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  31.64 
 
 
719 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  30.76 
 
 
721 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  30.1 
 
 
722 aa  271  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  29.39 
 
 
727 aa  270  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  32.97 
 
 
722 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  32.5 
 
 
706 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  34.19 
 
 
722 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  34.01 
 
 
722 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  30.96 
 
 
726 aa  263  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  34.38 
 
 
722 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.54 
 
 
694 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  30.98 
 
 
687 aa  257  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  29.53 
 
 
739 aa  253  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  27.7 
 
 
701 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>