More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01405 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
694 aa  1424    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  45.04 
 
 
718 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  45.04 
 
 
720 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  45.97 
 
 
723 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  48.54 
 
 
687 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  43.72 
 
 
725 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  44.31 
 
 
721 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  43.53 
 
 
719 aa  558  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  40.66 
 
 
740 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  40.9 
 
 
721 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  39.17 
 
 
762 aa  524  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  38.96 
 
 
704 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  40.6 
 
 
731 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  39.16 
 
 
731 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  39.16 
 
 
733 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  38.53 
 
 
734 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.29 
 
 
711 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  37.46 
 
 
704 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  37.99 
 
 
718 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  38.81 
 
 
712 aa  500  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
707 aa  494  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  38.52 
 
 
712 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  39.63 
 
 
734 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  38.2 
 
 
737 aa  480  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  39.42 
 
 
776 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  38.93 
 
 
718 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  39.82 
 
 
738 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  37.32 
 
 
721 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  38.54 
 
 
718 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  38.54 
 
 
718 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  38.39 
 
 
743 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  38.54 
 
 
718 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  38.46 
 
 
719 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  35.68 
 
 
738 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  37.18 
 
 
920 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  35.38 
 
 
767 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  36.51 
 
 
725 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  37.28 
 
 
722 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  36.54 
 
 
719 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  36.21 
 
 
723 aa  452  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  38.24 
 
 
756 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  35.93 
 
 
716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  37.43 
 
 
711 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  36.4 
 
 
718 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  36.34 
 
 
718 aa  438  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  34.93 
 
 
726 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  35.66 
 
 
726 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  34.63 
 
 
725 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  35.36 
 
 
726 aa  426  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  34.63 
 
 
726 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  34.71 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  34.71 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  34.71 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  34.56 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  34.78 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  34.63 
 
 
725 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  34.62 
 
 
725 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  35.02 
 
 
725 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  32.64 
 
 
730 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  36.05 
 
 
776 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  34.48 
 
 
727 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  34.32 
 
 
727 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  32.7 
 
 
718 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  35.06 
 
 
713 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  33.24 
 
 
726 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  34.96 
 
 
733 aa  372  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  35.55 
 
 
779 aa  372  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  32.7 
 
 
739 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  35.06 
 
 
723 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  32.56 
 
 
718 aa  361  3e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  31.29 
 
 
720 aa  339  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  34.75 
 
 
706 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  33.21 
 
 
712 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  32.68 
 
 
722 aa  333  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  33.03 
 
 
712 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  31.32 
 
 
730 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  31.82 
 
 
871 aa  325  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  28.89 
 
 
730 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  31.68 
 
 
729 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  29.19 
 
 
726 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  28.89 
 
 
726 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  28.89 
 
 
726 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0277  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.91 
 
 
722 aa  297  4e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358475  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  31.38 
 
 
726 aa  296  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  31.63 
 
 
722 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  32.33 
 
 
867 aa  293  8e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  31.07 
 
 
722 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  30.71 
 
 
722 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  30.71 
 
 
722 aa  291  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  28.85 
 
 
701 aa  289  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1599  ABC drug efflux transporter, fused ATPase and inner mebrane subunits  31.2 
 
 
751 aa  285  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.164249  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.52 
 
 
763 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.52 
 
 
763 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0786  ABC transporter related  30.7 
 
 
722 aa  275  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  28.91 
 
 
731 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2413  ABC transporter related  29.05 
 
 
765 aa  273  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.157605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.95 
 
 
726 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  31.5 
 
 
742 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  28.7 
 
 
731 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  29.92 
 
 
750 aa  267  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>