More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1664 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 718 aa  1461    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  45.08 
 
 		 704 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  55.98 
 
 		 725 aa  793    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  47.71 
 
 		 731 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  45.08 
 
 		 707 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  57.42 
 
 		 723 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0785  type I secretion system ATPase  81.92 
 
 		 720 aa  1209    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.42075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  49.01 
 
 		 740 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1875  putative ABC transporter  49.15 
 
 		 721 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147039 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  56.27 
 
 		 719 aa  792    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  56.98 
 
 		 721 aa  801    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  45.22 
 
 		 704 aa  649    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  47.56 
 
 		 687 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  44.08 
 
 		 762 aa  647    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  47.38 
 
 		 731 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  47.52 
 
 		 733 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  41.28 
 
 		 734 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.78 
 
 		 711 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.04 
 
 		 694 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  42.33 
 
 		 712 aa  627  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  43.63 
 
 		 718 aa  618  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  42.27 
 
 		 712 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  42.96 
 
 		 738 aa  593  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  43.22 
 
 		 776 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1160  cyclic nucleotide-binding protein  42.67 
 
 		 734 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.222605 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0564  type I secretion system ATPase  42.17 
 
 		 743 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  41.24 
 
 		 718 aa  575  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1418  ATPase  42.2 
 
 		 756 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.702704  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3062  type I secretion system ATPase  41.03 
 
 		 767 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  40.95 
 
 		 718 aa  573  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  41.18 
 
 		 738 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  41.76 
 
 		 722 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  39.63 
 
 		 723 aa  549  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  41.34 
 
 		 721 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4140  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 726 aa  545  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  41.27 
 
 		 718 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  39.97 
 
 		 737 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0476  type I secretion system ATPase  38.63 
 
 		 726 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  39.38 
 
 		 725 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  40.86 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1461  ABC transporter, transmembrane region  41.39 
 
 		 719 aa  532  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 726 aa  531  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  40.72 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  40.86 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  40.4 
 
 		 716 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4318  toxin secretion ATP-binding protein  39.2 
 
 		 726 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  39.37 
 
 		 725 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  39.23 
 
 		 725 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  39.23 
 
 		 725 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0367  ABC transporter related  39.51 
 
 		 725 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  39.26 
 
 		 920 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  39.37 
 
 		 725 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3592  ABC transporter related  39.34 
 
 		 725 aa  522  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1634  ABC transporter related  38.23 
 
 		 730 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0383  ABC transporter related  39.2 
 
 		 725 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3643  ABC transporter related  39.06 
 
 		 725 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0381  ABC transporter related  39.2 
 
 		 725 aa  525  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3810  type I secretion system ATPase  40.65 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0383  ABC transporter related  38.28 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  38.33 
 
 		 718 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2777  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 		 727 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1077  type I secretion system ATPase  37.6 
 
 		 726 aa  487  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3149  ABC transporter related  38.51 
 
 		 776 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2501  ABC transporter  39.17 
 
 		 733 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.576449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  35.79 
 
 		 719 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2300  type I secretion system ATPase  37.61 
 
 		 739 aa  441  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0381  ATPase  39.71 
 
 		 718 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.700678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  37.76 
 
 		 712 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 712 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0584  type I secretion system ATPase family protein  35.21 
 
 		 720 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  36.64 
 
 		 779 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3410  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.08 
 
 		 713 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277715  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  35.62 
 
 		 723 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1002  ABC transporter related  34.34 
 
 		 722 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4207  ABC transporter related  35.54 
 
 		 706 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4601  type I secretion system ATPase  35.17 
 
 		 730 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2167  ABC transporter related  33.8 
 
 		 729 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.171224  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_003296  RS05072  ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 739 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  34.59 
 
 		 742 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4382  type I secretion system ATPase  36.83 
 
 		 722 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971787  normal  0.361781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0529  ABC transporter related  32.44 
 
 		 871 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.299767  normal  0.097306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  36.68 
 
 		 722 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  36.38 
 
 		 722 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2907  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  35.94 
 
 		 726 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2888  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  35.76 
 
 		 726 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2837  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  35.94 
 
 		 726 aa  360  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2906  protein secretion ABC efflux system permease and ATP-binding protein  35.94 
 
 		 726 aa  360  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.452451  normal  0.0897932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  36.23 
 
 		 722 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3121  ABC transporter related  32.82 
 
 		 730 aa  348  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.184456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  34.3 
 
 		 700 aa  343  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1190  ABC transporter-related protein  32.4 
 
 		 701 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.94 
 
 		 724 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.94 
 
 		 724 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2196  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  33.57 
 
 		 763 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.338051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2060  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.57 
 
 		 763 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2275  ABC transporter related  32.91 
 
 		 714 aa  333  8e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.405946  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  36.15 
 
 		 724 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0760  ABC transporter related  33.1 
 
 		 867 aa  331  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00472894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.23 
 
 		 699 aa  331  3e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4070  ABC transporter related  35.68 
 
 		 724 aa  328  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00000105324  normal  0.180346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>