More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2000 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  100 
 
 
566 aa  1137    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.51 
 
 
587 aa  433  1e-120  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  35.49 
 
 
599 aa  343  4e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  34.19 
 
 
625 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  31.62 
 
 
623 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  31.79 
 
 
609 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  33.56 
 
 
592 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  33.2 
 
 
625 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  31.29 
 
 
604 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.91 
 
 
596 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  32.18 
 
 
614 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  28.77 
 
 
621 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
616 aa  282  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.78 
 
 
619 aa  279  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  27.52 
 
 
621 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  27.52 
 
 
621 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  29.83 
 
 
618 aa  276  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  29.65 
 
 
618 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  30.74 
 
 
618 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  30.64 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  31.17 
 
 
615 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.7 
 
 
611 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  30.8 
 
 
615 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  28.77 
 
 
603 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  33.02 
 
 
611 aa  263  6e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  30.1 
 
 
638 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.3 
 
 
603 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  29.88 
 
 
608 aa  256  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  27.27 
 
 
625 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.98 
 
 
600 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  31.36 
 
 
623 aa  247  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  30.35 
 
 
613 aa  247  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 
626 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  27.68 
 
 
618 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  28.11 
 
 
611 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  28.74 
 
 
616 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  32.44 
 
 
604 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  31.74 
 
 
591 aa  232  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  27.22 
 
 
626 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  28.57 
 
 
606 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  27.43 
 
 
621 aa  227  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  26.73 
 
 
627 aa  227  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  32.08 
 
 
594 aa  226  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  27.63 
 
 
619 aa  226  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  28.54 
 
 
617 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 
596 aa  220  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
596 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  29.46 
 
 
611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  25.34 
 
 
633 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.76 
 
 
633 aa  212  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  25.04 
 
 
626 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1518  ABC transporter related  33.41 
 
 
588 aa  211  3e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  28.39 
 
 
597 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  26.16 
 
 
595 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  27.25 
 
 
616 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  32.1 
 
 
593 aa  209  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 
603 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
662 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  29.65 
 
 
603 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  25.73 
 
 
603 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  27.51 
 
 
631 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  26.81 
 
 
618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  35.35 
 
 
753 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  23.81 
 
 
605 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  28.48 
 
 
608 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  31.1 
 
 
585 aa  198  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  33.6 
 
 
606 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0045  ABC transporter, ATP-binding protein  28.01 
 
 
614 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  25.14 
 
 
611 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  31.28 
 
 
626 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  27.77 
 
 
586 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.6 
 
 
608 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1255  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.62 
 
 
597 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261223  normal  0.738985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.64 
 
 
597 aa  193  8e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  29.96 
 
 
605 aa  193  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.59 
 
 
593 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.59 
 
 
583 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  39.07 
 
 
586 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  27.27 
 
 
623 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.08 
 
 
594 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.83 
 
 
597 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  33.53 
 
 
625 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
604 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  28.94 
 
 
583 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.16 
 
 
593 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  29.16 
 
 
623 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.16 
 
 
583 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  26.3 
 
 
619 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 
596 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 
596 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.38 
 
 
574 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.38 
 
 
575 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 
574 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.38 
 
 
575 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 
575 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  32.45 
 
 
624 aa  185  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  27.69 
 
 
578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.11 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  24.77 
 
 
626 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  26.28 
 
 
653 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>